RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055506.8

Gtf3c1-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c1, Length 6,961 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Stt3aP46978 705 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tango2P54797 276 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PrlrQ08501 608 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 1700061G19RikQ08EE8 705 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tnfaip8l3Q3TBL6 204 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Grm6Q5NCH9 871 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Arhgap11aQ80Y19 987 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ap3s2Q8BSZ2 193 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Clptm1lQ8BXA5 539 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm6367Q8C6L9 287 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mnd1Q8K396 205 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr806Q8VFI2 313 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Q9DAY5 185 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Chst7Q9EP78 484 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Abcc3B2RX12 1523 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ggta1l1A2AUQ7 319 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn1r12G5E8G1 307 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm3696K7N751 203 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Prl6a1O35257 230 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pitpnm1O35954 1243 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Il13ra2O88786 383 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Icam1P13597 537 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tbx3P70324 741 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem184cQ3TPR7 525 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ttc9Q3V038 219 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gpr165Q3V3A3 455 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sez6lQ6P1D5 963 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Serpina12Q7TMF5 413 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr58Q7TRF6 309 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ttc24Q8BYG0 334 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sox30Q8CGW4 782 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Depdc1aQ8CIG0 804 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MypopQ8R4U1 393 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc44a3Q921V7 656 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tmem159Q922Z1 161 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ctu1Q99J10 420 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MycsQ9Z304 431 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Smok4aA0JLX3 433 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Magea4F2Z493 315 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lrig1P70193 1091 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fbp2P70695 339 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fmo3P97501 534 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ano7Q14AT5 859 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn1r223Q5SSA0 361 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pnma8aQ80VM8 430 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Acat3Q80X81 397 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fam83eQ80XS7 481 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gpr89aQ8BS95 455 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kctd15Q8K0E1 283 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zfp709Q8VC29 727 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Grm3Q9QYS2 879 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Myh7Q91Z83 1935 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mettl8A2AUU0 281 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm266A6H634 200 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dcpp3L7N259 170 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Entpd7Q3TCT4 606 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pea15Q62048 130 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 DgkbQ6NS52 802 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kctd9Q80UN1 339 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sp8Q8BMJ8 486 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Aimp2Q8R010 320 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 As3mtQ91WU5 376 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 LiasQ99M04 373 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rnf128Q9D304 428 aa10.99□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Atp10bB1AWN4 1474 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1480A0A140LIR8 359 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm13119B1ARV5 481 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Nsmce4aG3XA30 381 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mcpt1P11034 246 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Wnt7aP24383 349 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cpne2P59108 548 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zyg11bQ3UFS0 744 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 EdnraQ61614 427 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gulp1Q8K2A1 304 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dennd1aQ8K382 1016 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fam129bQ8R1F1 749 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cxxc5Q91WA4 317 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc7a5Q9Z127 512 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zfp946F6VWU8 523 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ninj1O70131 152 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ido1P28776 407 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Smim24Q0VG18 120 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Kcnc2Q14B80 642 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc22a16Q497L8 649 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cdh12Q5RJH3 794 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 AY358078Q6UY53 465 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1231Q7TQZ8 313 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Wscd1Q80XH4 572 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Otud7aQ8R554 926 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fbxl20Q9CZV8 436 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 S100a2J3QMC7 104 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Il1r1P13504 576 aa10.98□□□□□ -0.65
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 H2-Q8P14430 326 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.7 ms