RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 GPR158Q5T848 1215 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 WLSQ5T9L3 541 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 ICE2Q659A1 982 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 TXNDC8Q6A555 127 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 MAVSQ7Z434 540 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 ISCA2Q86U28 154 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 CUZD1Q86UP6 607 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 CMTM8Q8IZV2 173 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 PELI3Q8N2H9 469 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 CCNYL1Q8N7R7 359 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 KDM1BQ8NB78 822 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 ECHDC3Q96DC8 303 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 EXOC2Q96KP1 924 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 PANX3Q96QZ0 392 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 CLPBQ9H078 707 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 P2RY12Q9H244 342 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 PNPOQ9NVS9 261 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 SMOXQ9NWM0 555 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 ARMCX1Q9P291 453 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.09□□□□□ -1.11
CTXN3-204ENST00000620385 BRCA2P51587 3418 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 TSPAN11A1L157 253 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 DYTNA2CJ06 578 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 AURKAO14965 403 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 KPNA5O15131 536 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 DCXO43602 365 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 ICMTO60725 284 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 PEX11AO75192 247 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 PRAMEF1O95521 474 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 TSPAN15O95858 294 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 CHRNGP07510 517 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 COX4I1P13073 169 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 GFAPP14136 432 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 ARRB2P32121 409 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 NNMTP40261 264 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 CCR3P51677 355 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 ACTR3P61158 418 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 CYP4F8P98187 520 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 KDSRQ06136 332 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 LMAN2Q12907 356 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 STX5Q13190 355 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 SP140Q13342 867 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 NFATC2Q13469 925 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF77Q15935 545 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 GSTA3Q16772 222 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF549Q6P9A3 640 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 CLYBLQ8N0X4 340 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 PGAM4Q8N0Y7 254 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 FBXO39Q8N4B4 442 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 AGAP11Q8TF27 550 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 TSPEARQ8WU66 669 aa8.08□□□□□ -1.12
CTXN3-204ENST00000620385 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms