RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614484.4

SRRT-215, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRRT, Length 2,964 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-215ENST00000614484 RASSF5Q8WWW0 418 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 CHFRQ96EP1 664 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 SGF29Q96ES7 293 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 OLFM1Q99784 485 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 CIPCQ9C0C6 399 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 COL4A3Q01955 1670 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 LINC01387J3KSC0 135 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 MT-CO1P00395 513 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 GSTM2P28161 218 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 RBL1P28749 1068 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 WASP42768 502 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 CYP4F2P78329 520 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 CYP4F3Q08477 520 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 SCRN3Q0VDG4 424 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 OLIG2Q13516 323 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 CCNIQ14094 377 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 ACAP2Q15057 778 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 POM121L1PQ3SYA9 428 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 OR6C4Q8NGE1 309 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 OR8H1Q8NGG4 311 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 JADE3Q92613 823 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 PLD4Q96BZ4 506 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 KCNK12Q9HB15 430 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 HEBP1Q9NRV9 189 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 NEU3Q9UQ49 428 aa11.9□□□□□ -0.5
SRRT-215ENST00000614484 HSMCR30P0CW71 290 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 DBTP11182 482 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 STK19P49842 368 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 HK2P52789 917 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 SNTA1Q13424 505 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 SGCAQ16586 387 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 LRRC38Q5VT99 294 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 OR7E24Q6IFN5 339 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 PAOXQ6QHF9 649 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 DEPDC4Q8N2C3 294 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 NTAN1Q96AB6 310 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 CMTM3Q96MX0 182 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 C1orf21Q9H246 121 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 VPS28Q9UK41 221 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 TMEM265A0A087WTH1 108 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 WASH3PC4AMC7 463 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 KCNN4O15554 427 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 DENRO43583 198 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 SSX5O60225 188 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 CSKP41240 450 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 ARHGDIAP52565 204 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 NR1H2P55055 460 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 AQP5P55064 265 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 SEC13P55735 322 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 GPX6P59796 221 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 RING1Q06587 406 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 ITKQ08881 620 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 PDK2Q15119 407 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 TBCCQ15814 346 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 KCTD4Q8WVF5 259 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 BORCS5Q969J3 196 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 ATP6V1E2Q96A05 226 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 VPS33AQ96AX1 596 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 EHD3Q9NZN3 535 aa11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 ZBTB14O43829 449 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 PEX1O43933 1283 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 DNAJA2O60884 412 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 IL33O95760 270 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 VAMP1P23763 118 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 SEMA3BQ13214 749 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 DHCR24Q15392 516 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 RALGPS1Q5JS13 557 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 ARTNQ5T4W7 220 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 Q6ZNB5 142 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 TCAIMQ8N3R3 496 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 TTC9Q92623 222 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 HPS1Q92902 700 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 IRF7Q92985 503 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 ZNF670Q9BS34 389 aa11.88□□□□□ -0.51
SRRT-215ENST00000614484 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms