RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601665.5

NUP62-223, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 5

Gene NUP62, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-223	ENST00000601665	CDH3	P22223	829 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	CA5A	P35218	305 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	RORA	P35398	523 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	HADHA	P40939	763 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	FOLR3	P41439	243 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	CDC16	Q13042	620 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	RPE65	Q16518	533 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	DPYSL2	Q16555	572 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	CYP2A13	Q16696	494 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	QPCT	Q16769	361 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	VWA2	Q5GFL6	755 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	MLIP	Q5VWP3	458 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	CARF	Q8N187	725 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	NEK11	Q8NG66	645 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	GPR150	Q8NGU9	434 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	CNDP1	Q96KN2	507 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	GBP5	Q96PP8	586 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	CHST11	Q9NPF2	352 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	OR6C74	A6NCV1	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	DIAPH2	O60879	1101 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	KCNJ13	O60928	360 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	LCA5L	O95447	670 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	PRL	P01236	227 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	CAPN1	P07384	714 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	HBQ1	P09105	142 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	PREP	P48147	710 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	DCDC1	P59894	354 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	ABR	Q12979	859 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	KRT81	Q14533	505 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	SSPN	Q14714	243 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	BOLA3	Q53S33	107 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	AMZ2	Q86W34	360 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	GPR26	Q8NDV2	337 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	COG1	Q8WTW3	980 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	FAR1	Q8WVX9	515 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	AMACR	Q9UHK6	382 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	BTRC	Q9Y297	605 aa		11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
NUP62-223	ENST00000601665	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		11.96	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	SPG11	Q96JI7	2443 aa		11.96	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	SEC16A	O15027	2179 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	SPTB	P11277	2137 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665		E7EQ34	232 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	E2F3	O00716	465 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	MATN3	O15232	486 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	STS	P08842	583 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	CD86	P42081	329 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	GALNT3	Q14435	633 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	KRT33B	Q14525	404 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	HIF1A	Q16665	826 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	OR1L3	Q8NH93	324 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	TEKT4	Q8WW24	435 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	HLA-DQB2	P05538	268 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	CD63	P08962	238 aa		11.94	□□□□□ -0.5
NUP62-223	ENST00000601665	PIRT	P0C851	137 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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