RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CTDNEP1-208	ENST00000573600	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SDHD	O14521	159 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NUAK1	O60285	661 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MMP20	O60882	483 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	WAS	P42768	502 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KCNJ2	P63252	427 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	AGAP11	Q8TF27	550 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	AZIN1	O14977	448 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VCL	P18206	1134 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TIE1	P35590	1138 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	AGTR2	P50052	363 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CST6	Q15828	149 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	AP1G1	O43747	822 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SGTA	O43765	313 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	C5AR1	P21730	350 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CTH	P32929	405 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NXN	Q6DKJ4	435 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HGH1	Q9BTY7	390 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MRGBP	Q9NV56	204 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	E2F3	O00716	465 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLC22A2	O15244	555 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	C8G	P07360	202 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KANK2	Q63ZY3	851 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SDE2	Q6IQ49	451 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ELMO1	Q92556	727 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MID1	O15344	667 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TSPAN6	O43657	245 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PRDX6	P30041	224 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DRD3	P35462	400 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GPR1	P46091	355 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SEC13	P55735	322 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GIPC1	O14908	333 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DCX	O43602	365 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ATG13	O75143	517 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SOD1	P00441	154 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NTSR1	P30989	418 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PRLHR	P49683	370 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MNAT1	P51948	309 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EGFL8	Q99944	293 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FBRS	Q9HAH7	460 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	OR2AG2	A6NM03	316 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PPP6C	O00743	305 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	INPP4B	O15327	924 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLC16A5	O15375	505 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ESRRB	O95718	433 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CDC16	Q13042	620 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SP140	Q13342	867 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RBBP7	Q16576	425 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PHKG1	Q16816	387 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	OR2T3	Q8NH03	318 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		28.59	■■■□□ 2.17

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