RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564582.2

CHD9-210, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 9, humanhuman

TSL 3

Gene CHD9, Length 968 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9-210ENST00000564582 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 HDAC3O15379 428 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 MAGEB3O15480 346 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ARHGEF9O43307 516 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 AVILO75366 819 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 RPS6KA4O75676 772 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 SEC14L2O76054 403 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CRYZL1O95825 349 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 APOC2P02655 101 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 SNHG28P0DPA3 235 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CHRNB1P11230 501 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 AKAP5P24588 427 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 FASP25445 335 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 GSTM2P28161 218 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 HSPA1LP34931 641 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 HOXD13P35453 343 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CPA2P48052 419 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 MARCKSL1P49006 195 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 PPP5CP53041 499 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 IST1P53990 364 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 SNX16P57768 344 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CSNK2BP67870 215 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ZNF45Q02386 682 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 MERTKQ12866 999 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 PRKAA1Q13131 559 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 IL18R1Q13478 541 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 GALNT3Q14435 633 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 TSC22D1Q15714 1073 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CSRP2Q16527 193 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 RFX4Q33E94 735 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ODR4Q5SWX8 454 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 TAS2R42Q7RTR8 314 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CATSPER3Q86XQ3 398 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 HPS6Q86YV9 775 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ARHGEF19Q8IW93 802 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 DSELQ8IZU8 1212 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 NDUFAF2Q8N183 169 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 PARP8Q8N3A8 854 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ARL10Q8N8L6 244 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 IFI44Q8TCB0 444 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 VPS33AQ96AX1 596 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 BTN2A3PQ96KV6 586 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CCDC17Q96LX7 622 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 SLITRK1Q96PX8 696 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CDRT15Q96T59 188 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 HPS4Q9NQG7 708 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 IL17RBQ9NRM6 502 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 TAS2R14Q9NYV8 317 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 TXNDC16Q9P2K2 825 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 SLC17A7Q9P2U7 560 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 NUP50Q9UKX7 468 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 SARDHQ9UL12 918 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 MKLN1Q9UL63 735 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 FZD1Q9UP38 647 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 POLHQ9Y253 713 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 ITM2BQ9Y287 266 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 CHST2Q9Y4C5 530 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 HEY1Q9Y5J3 304 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 SNX5Q9Y5X3 404 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 TEX264Q9Y6I9 313 aa5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 EMSYQ7Z589 1322 aa5.54□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa5.54□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa5.54□□□□□ -1.52
CHD9-210ENST00000564582 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa5.54□□□□□ -1.52
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