RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 SLC35B2Q8TB61 432 aa9.15□□□□□ -0.94
SMAD3-215ENST00000560424 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.15□□□□□ -0.94
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SMAD3-215ENST00000560424 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9.15□□□□□ -0.94
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SMAD3-215ENST00000560424 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
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SMAD3-215ENST00000560424 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.14□□□□□ -0.95
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SMAD3-215ENST00000560424 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
SMAD3-215ENST00000560424 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
SMAD3-215ENST00000560424 NEU2Q9Y3R4 380 aa9.14□□□□□ -0.95
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SMAD3-215ENST00000560424 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
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SMAD3-215ENST00000560424 J3KR12 359 aa9.13□□□□□ -0.95
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SMAD3-215ENST00000560424 ATP8B1O43520 1251 aa9.13□□□□□ -0.95
SMAD3-215ENST00000560424 CST8O60676 142 aa9.13□□□□□ -0.95
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SMAD3-215ENST00000560424 ALPPP05187 535 aa9.13□□□□□ -0.95
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SMAD3-215ENST00000560424 GJC1P36383 396 aa9.13□□□□□ -0.95
SMAD3-215ENST00000560424 ARL4AP40617 200 aa9.13□□□□□ -0.95
SMAD3-215ENST00000560424 RGRP47804 291 aa9.13□□□□□ -0.95
SMAD3-215ENST00000560424 ARL4DP49703 201 aa9.13□□□□□ -0.95
SMAD3-215ENST00000560424 AP1S1P61966 158 aa9.13□□□□□ -0.95
SMAD3-215ENST00000560424 VSNL1P62760 191 aa9.13□□□□□ -0.95
SMAD3-215ENST00000560424 XRCC4Q13426 336 aa9.13□□□□□ -0.95
SMAD3-215ENST00000560424 TUBB3Q13509 450 aa9.13□□□□□ -0.95
SMAD3-215ENST00000560424 KRT81Q14533 505 aa9.13□□□□□ -0.95
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