RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACSBG2Q5FVE4 666 aa16.95■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.95■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCAS4Q8TDM0 211 aa16.95■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIAA1191Q96A73 305 aa16.95■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 COX14Q96I36 57 aa16.95■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 LGR4Q9BXB1 951 aa16.95■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa16.95■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 TARM1B6A8C7 271 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 DLX3O60479 287 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM13O60858 407 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 FSBPO95073 299 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEAD1P28347 426 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUDT1P36639 197 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRLHRP49683 370 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 STX3Q13277 289 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR4D1Q15615 310 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSNQ15631 228 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGS9BPQ6ZS82 235 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1orf210Q8IVY1 113 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 FRMD1Q8N878 549 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 RHEBL1Q8TAI7 183 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCM2Q9BSQ5 444 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 PITPNM3Q9BZ71 974 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCED1AQ9H1Q7 454 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPHX3Q9H6B9 360 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 OXSMQ9NWU1 459 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMIM24O75264 130 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 CBSLP0DN79 551 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKT2P31751 481 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 CBSP35520 551 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGFALSP35858 605 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNC1P48547 511 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYTL3Q4VX76 610 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 LIPMQ5VYY2 423 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC36A4Q6YBV0 504 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXL6Q8N531 539 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM105Q8N8V8 129 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEX101Q9BY14 249 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP4F12Q9HCS2 524 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHL42Q9P2K6 505 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 IKZF3Q9UKT9 509 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 INVSQ9Y283 1065 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa16.94■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 NEMP2A6NFY4 417 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 FPGTO14772 594 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP3K13O43283 966 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 SUPT3HO75486 399 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGHV4-34P06331 123 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 TPBGLP0DKB5 382 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM23P36406 574 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 BST1Q10588 318 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASPHQ12797 758 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSSK4Q6SA08 328 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRTC3Q6UUV7 619 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 DTWD2Q8NBA8 298 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 BIRC7Q96CA5 298 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC126Q96EE4 140 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 PHF21BQ96EK2 531 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 DMTF1Q9Y222 760 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.93■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYCE1LA8MT33 242 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 C10orf142B7Z368 130 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBXN8O00124 270 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 NDUFAB1O14561 156 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLF11O14901 512 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 KERAO60938 352 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM107AO95990 144 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERPINE1P05121 402 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 DRD4P21917 467 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCL7AQ4VC05 210 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNX19Q92543 992 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 FOXJ1Q92949 421 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM159Q96B96 161 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATOH8Q96SQ7 321 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 APOOQ9BUR5 198 aa16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR34Q9UPC5 381 aa16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms