RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 CCL22O00626 93 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 HGSO14964 777 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 NDUFS3O75489 264 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TTC4O95801 387 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ARSDP51689 593 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 OR1D5P58170 312 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TUBB2AQ13885 445 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT33BQ14525 404 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TMED2Q15363 201 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 AMZ1Q400G9 498 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SYTL3Q4VX76 610 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM26Q6ZUK4 368 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF534Q76KX8 674 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 JAMLQ86YT9 394 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PDIK1LQ8N165 341 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SNF8Q96H20 258 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TUBB2BQ9BVA1 445 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 EPB41L5Q9HCM4 733 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 THSD1Q9NS62 852 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 GNPTGQ9UJJ9 305 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 MRFAP1Q9Y605 127 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM187AA6NFU0 413 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 DXOO77932 396 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 USP1O94782 785 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM63AO94886 807 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 C1QTNF9P0C862 333 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 AMD1P17707 334 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 OGNP20774 298 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TERF1P54274 439 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 DRG2P55039 364 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 GABREP78334 506 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 NFE2L1Q14494 772 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM71Q6P5X7 295 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PIANPQ8IYJ0 282 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 GSDMBQ8TAX9 411 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRC39Q96DD0 335 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CARD6Q9BX69 1037 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 COG4Q9H9E3 785 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SPEGQ15772 3267 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 B4GAT1O43505 415 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 UBXN7O94888 489 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 VAPBO95292 243 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 EML2O95834 649 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RPN2P04844 631 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 JMJD7P0C870 316 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PGAM1P18669 254 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 NMBRP28336 390 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CD1CP29017 333 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC19A1P41440 591 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PTGIRP43119 386 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGEA3P43357 314 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 LIMK2P53671 638 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CRADDP78560 199 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 CALCOCO2Q13137 446 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PLCL1Q15111 1095 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 PHF19Q5T6S3 580 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM164Q5U3C3 297 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRD22Q5VYY1 191 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SPATA4Q8NEY3 305 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR150Q8NGU9 434 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ELMO1Q92556 727 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 C12orf66Q96MD2 445 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF778Q96MU6 729 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT12Q99456 494 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 B3GNT4Q9C0J1 378 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB17Q9H0T7 212 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC40A1Q9NP59 571 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-205ENST00000558534 OR51F1A6NGY5 319 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms