RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654		J3QR06	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PLK4	O00444	970 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ZBTB43	O43298	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	BMP10	O95393	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CGA	P01215	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TFAP2A	P05549	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	LAMP2	P13473	410 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SELL	P14151	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF23	P17027	643 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CHM	P24386	653 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	GPR143	P51810	404 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	MLLT10	P55197	1068 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	HILS1	P60008	231 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TFAP4	Q01664	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PSD2	Q9BQI7	771 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	NUP160	Q12769	1436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ABCC2	Q92887	1545 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PLXNC1	O60486	1568 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654		A0A1W2PPI3	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654		A8MZ25	164 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SCAMP1	O15126	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	EDIL3	O43854	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PDE9A	O76083	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	NR3C1	P04150	777 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	MSH3	P20585	1137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PTMS	P20962	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CTSC	P53634	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	LRMP	Q12912	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	LITAF	Q99732	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SH2D4A	Q9H788	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PIK3C2G	O75747	1445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	OR2C1	O95371	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	GCNT3	O95395	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GPHN-215	ENST00000557654	TUBB	P07437	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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