RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	RDH14	Q9HBH5	336 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		12.11	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	FAM187A	A6NFU0	413 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	OR2AG2	A6NM03	316 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CCL22	O00626	93 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM63A	O94886	807 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	TNFSF15	O95150	251 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	HGF	P14210	728 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	IVD	P26440	423 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CD1C	P29017	333 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	TTPA	P49638	278 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CTSC	P53634	463 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	MORF4L2	Q15014	288 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	METRNL	Q641Q3	311 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	PDZD3	Q86UT5	571 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	JAML	Q86YT9	394 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	BBOF1	Q8ND07	529 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	SGF29	Q96ES7	293 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF778	Q96MU6	729 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM74	Q96NL1	305 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	NAT9	Q9BTE0	207 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	SYBU	Q9NX95	663 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	BPTF	Q12830	3046 aa		12.1	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	PFDN6	O15212	129 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	SGTA	O43765	313 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	SNX2	O60749	519 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CPNE6	O95741	557 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CCKBR	P32239	447 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	HAL	P42357	657 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	ABCG1	P45844	678 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	EPHA4	P54764	986 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	GPLD1	P80108	840 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	HHEX	Q03014	270 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CFHR1	Q03591	330 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	RPA4	Q13156	261 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	DBN1	Q16643	649 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM135	Q86UB9	458 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	PIM3	Q86V86	326 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	HM13	Q8TCT9	377 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	TCF12	Q99081	682 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	POT1	Q9NUX5	634 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	CDC23	Q9UJX2	597 aa		12.09	□□□□□ -0.47
RBM23-231	ENST00000557549	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC78	A2IDD5	438 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	PLD2	O14939	933 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	TTI1	O43156	1089 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RBM23-231	ENST00000557549	USP1	O94782	785 aa		12.08	□□□□□ -0.48

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