RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556321.1

PSMA3-210, Transcript of proteasome subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene PSMA3, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSMA3-210	ENST00000556321	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ITGB4	P16144	1822 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	NSD2	O96028	1365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A1W2PPM1	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321		H0YIN7	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321		M0QZ24	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PROP1	O75360	226 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TOMM70	O94826	608 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ZWINT	O95229	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CTSA	P10619	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SRC	P12931	536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PFKFB1	P16118	471 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PROZ	P22891	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PPP3CC	P48454	512 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	LIMK1	P53667	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	UBXN1	Q04323	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	NEDD9	Q14511	834 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321		A0A1W2PP64	1363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ADCY9	O60503	1353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MDM4	O15151	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CLIC2	O15247	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	FOXN1	O15353	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SLC22A3	O75751	556 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	LATS1	O95835	1130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	CHRNB2	P17787	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	HSPA4	P34932	840 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PCGF2	P35227	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TMPRSS3	P57727	454 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	DUSP6	Q16828	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSMA3-210	ENST00000556321	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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