RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 OR5AL1P0C617 328 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PCP11498 1178 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MYOGP15173 224 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 GRK6P43250 576 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CDK16Q00536 496 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CAMK2BQ13554 666 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CRY1Q16526 586 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 UBE2UQ5VVX9 321 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PLPP4Q5VZY2 271 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 OR6B2Q6IFH4 312 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 KCNV1Q6PIU1 500 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM131AQ6UXB0 335 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 KCTD1Q719H9 257 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZFP82Q8N141 532 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC35G2Q8TBE7 412 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FBXW5Q969U6 566 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 AK8Q96MA6 479 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 LPIN3Q9BQK8 851 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF649Q9BS31 505 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM117Q9H0C3 514 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ABCG5Q9H222 651 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TCF7L1Q9HCS4 588 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TAS2R7Q9NYW3 318 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FNIP2Q9P278 1114 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SEC14L4Q9UDX3 406 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MTMR6Q9Y217 621 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 KIAA0232Q92628 1395 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM218A2RU14 115 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 WDR97A6NE52 1622 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 USP27XA6NNY8 438 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 D6RAR5 112 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NPIPA5E9PKD4 350 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 LATO43561 262 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FKBP6O75344 327 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CDK14O94921 469 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CYP1A2P05177 515 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CSF1P09603 554 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RAC2P15153 192 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 IFNGR1P15260 489 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 HOXA9P31269 272 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SLC1A1P43005 524 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 HCCSP53701 268 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SELENOVP59797 346 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TSPAN5P62079 268 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 DLGAP5Q15398 846 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TMEM97Q5BJF2 176 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 FAXCQ5TGI0 409 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 EMC10Q5UCC4 262 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ALG1LQ6GMV1 187 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 Q6ZUG5 572 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 LYSMD2Q8IV50 215 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SERPINA12Q8IW75 414 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 GPC2Q8N158 579 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PYDC1Q8WXC3 89 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TGM7Q96PF1 710 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ALG1Q9BT22 464 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NIF3L1Q9GZT8 377 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 AP5M1Q9H0R1 490 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 PLA2G4CQ9UP65 541 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ERGIC3Q9Y282 383 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 OR6C68A6NDL8 312 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 JAK2O60674 1132 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 EDF1O60869 148 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 SDC3O75056 442 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 DNAJB6O75190 326 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 F9P00740 461 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CDK1P06493 297 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 ABOP16442 354 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 RAB3AP20336 220 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 CCNOP22674 350 aa3.12□□□□□ -1.91
JMJD1C-210ENST00000542921 MC3RP41968 323 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms