RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542838.5

DDX11-223, Transcript of DEAD/H-box helicase 11, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDX11, Length 3,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX11-223	ENST00000542838	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	LAPTM5	Q13571	262 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	PWP1	Q13610	501 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF846	Q147U1	533 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	MON1A	Q86VX9	555 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		12.76	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	CLDN25	C9JDP6	229 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ARNTL	O00327	626 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	E2F3	O00716	465 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	VPS26A	O75436	327 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	EPO	P01588	193 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	FUT4	P22083	530 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	OR1E1	P30953	314 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	GABARAPL2	P60520	117 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	EPS8	Q12929	822 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	NR6A1	Q15406	480 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	METTL6	Q8TCB7	284 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF583	Q96ND8	569 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	PTGES3L	E9PB15	166 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	NIPSNAP2	O75323	286 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	NDST3	O95803	873 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	TBX18	O95935	607 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	CAPN1	P07384	714 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	HAL	P42357	657 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	GPR15	P49685	360 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	CD47	Q08722	323 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	KCNAB2	Q13303	367 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	NKG7	Q16617	165 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	DDR2	Q16832	855 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	PARP15	Q460N3	678 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	MIB1	Q86YT6	1006 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	OR2T12	Q8NG77	320 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	MUL1	Q969V5	352 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	TAMM41	Q96BW9	452 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	RMDN1	Q96DB5	314 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	LINGO1	Q96FE5	620 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF382	Q96SR6	550 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ACTL8	Q9H568	366 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	CPA4	Q9UI42	421 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	DFNA5	O60443	496 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	SPESP1	Q6UW49	350 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	PARP8	Q8N3A8	854 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	OR10A6	Q8NH74	314 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	VAPA	Q9P0L0	249 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	SCML2	Q9UQR0	700 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	CPQ	Q9Y646	472 aa		12.75	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	PRAMEF11	O60813	436 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	INMT	O95050	263 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	TRIM32	Q13049	653 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	PERM1	Q5SV97	790 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	GIPC2	Q8TF65	315 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	ITPKC	Q96DU7	683 aa		12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
DDX11-223	ENST00000542838	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37

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