RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 MAP3K3Q99759 626 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 HEMGNQ9BXL5 484 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 LHX9Q9NQ69 397 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 SMOXQ9NWM0 555 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 KCND3Q9UK17 655 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 RARRES3Q9UL19 164 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ARL5AQ9Y689 179 aa16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CDC14CA4D256 554 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEF1O95521 474 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 MT-ND3P03897 115 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 RBL1P28749 1068 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 AKT1P31749 480 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 XRCC4Q13426 336 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 DNASE1L3Q13609 305 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CYB5D1Q6P9G0 228 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 BBS12Q6ZW61 710 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TMEM135Q86UB9 458 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CT55Q8WUE5 264 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 NAT14Q8WUY8 206 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 KRT35Q92764 455 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 GORASP1Q9BQQ3 440 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FICDQ9BVA6 458 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 GBA3Q9H227 469 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FAM8A1Q9UBU6 413 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 POLHQ9Y253 713 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PIPSLA2A3N6 862 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 OR5K3A6NET4 321 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 MGAT4DA6NG13 374 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 H7C0C1 242 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 K7EM74 188 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CREG1O75629 220 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 NTRK1P04629 796 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 EBLN1P0CF75 366 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 NR1D1P20393 614 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ATP5OP48047 213 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ARL4DP49703 201 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 GEMP55040 296 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FOXK1P85037 733 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 OLIG2Q13516 323 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CCDC181Q5TID7 509 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 OR4K2Q8NGD2 314 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 WWP1Q9H0M0 922 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ASB8Q9H765 288 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa16.53■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 HECTD1Q9ULT8 2610 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TLCD2A6NGC4 264 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 C2orf81A6NN90 581 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ANXA9O76027 345 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 SRP72O76094 671 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 LCA5LO95447 670 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 APOC2P02655 101 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ACY1Q03154 408 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 C11orf63Q6NUN7 778 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 RANBP10Q6VN20 620 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 KMT5CQ86Y97 462 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 TC2NQ8N9U0 490 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 OR2L2Q8NH16 312 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 C12orf66Q96MD2 445 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FCRL4Q96PJ5 515 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 RUFY1Q96T51 708 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 CD180Q99467 661 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 APOL2Q9BQE5 337 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FGF21Q9NSA1 209 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 FKBPLQ9UIM3 349 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.52■□□□□ 0.24
HERC3-211ENST00000513325 C21orf140B9A014 251 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 MKRN2OSH3BPM6 223 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 RECKO95980 971 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 POLBP06746 335 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 ADRA1AP35348 466 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 HSD11B2P80365 405 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 KLRB1Q12918 225 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 TCTN3Q6NUS6 607 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 DAAM2Q86T65 1068 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 OOSP2Q86WS3 158 aa16.51■□□□□ 0.23
HERC3-211ENST00000513325 D2HGDHQ8N465 521 aa16.51■□□□□ 0.23
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