RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1-208ENST00000511439 RRM2BQ7LG56 351 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 THNSL1Q8IYQ7 743 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TMEM163Q8TC26 289 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TMEM18Q96B42 140 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 RNF183Q96D59 192 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 HEMGNQ9BXL5 484 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 SMC4Q9NTJ3 1288 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TAS2R10Q9NYW0 307 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 SELENONQ9NZV5 590 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 SARDHQ9UL12 918 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 PNMA2Q9UL42 364 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 MYH2Q9UKX2 1941 aa3.64□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 EVPLQ92817 2033 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 A0A087X0M5 115 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 A0A1B0GX30 115 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 HIDE1A8MVS5 230 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 BECN2A8MW95 431 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 RRP8O43159 456 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 KRT86O43790 486 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TACC1O75410 805 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 HEXAP06865 529 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 SLC2A4P14672 509 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 SRD5A1P18405 259 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 GNLYP22749 145 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 ABCD1P33897 745 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 RFX2P48378 723 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 CXCR3P49682 368 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 CCR9P51686 369 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 EFNA5P52803 228 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 PGGT1BP53609 377 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 ZP1P60852 638 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 GSTO1P78417 241 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 FAM27E3Q08E93 113 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TRAF1Q13077 416 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 KRT81Q14533 505 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TAF11Q15544 211 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 FAM180BQ6P0A1 224 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 KIF1BPQ96EK5 621 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 KLHL15Q96M94 604 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 SLC25A18Q9H1K4 315 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 CDT1Q9H211 546 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 PDCL3Q9H2J4 239 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 SH2D4AQ9H788 454 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 CAMK2AQ9UQM7 478 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 FLT1P17948 1338 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 ITIH6Q6UXX5 1313 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 KIAA1671Q9BY89 1806 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 NID2Q14112 1375 aa3.63□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 MCM3APO60318 1980 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 PI4KAP2A4QPH2 592 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 KLRF2D3W0D1 207 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 LDB2O43679 373 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 CAVIN2O95810 425 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 AFPP02771 609 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 LCATP04180 440 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 CYP1A2P05177 515 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 LDHCP07864 332 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 CCDC192P0DO97 292 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 EDN2P20800 178 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 POU1F1P28069 291 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 MAN1A1P33908 653 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 CXCL12P48061 93 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 CLDN2P57739 230 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 LMOD3Q0VAK6 560 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 HTR4Q13639 388 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 CAPSQ13938 189 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 GPR18Q14330 331 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 LPIN1Q14693 890 aa3.62□□□□□ -1.83
TOPBP1-208ENST00000511439 PPP2R5BQ15173 497 aa3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 247.6 ms