RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF185O15231 689 aa18.32■□□□□ 0.52
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SH3BP2-218ENST00000511185 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
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SH3BP2-218ENST00000511185 MAIP1Q8WWC4 291 aa18.32■□□□□ 0.52
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SH3BP2-218ENST00000511185 SH3KBP1Q96B97 665 aa18.31■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
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SH3BP2-218ENST00000511185 C12orf66Q96MD2 445 aa18.3■□□□□ 0.52
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SH3BP2-218ENST00000511185 CPNE5Q9HCH3 593 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 SYBUQ9NX95 663 aa18.3■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 EFCAB7A8K855 629 aa18.29■□□□□ 0.52
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SH3BP2-218ENST00000511185 FANCGO15287 622 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 OR1I1O60431 355 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNJ13O60928 360 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 ADRA1DP25100 572 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 MGAT1P26572 445 aa18.29■□□□□ 0.52
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SH3BP2-218ENST00000511185 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP1B1Q16678 543 aa18.29■□□□□ 0.52
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SH3BP2-218ENST00000511185 AFTPHQ6ULP2 937 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa18.29■□□□□ 0.52
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SH3BP2-218ENST00000511185 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 ART4Q93070 314 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF31Q96EP0 1072 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 TGM7Q96PF1 710 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRAC1Q9NRG0 131 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX12Q9UMY4 172 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF5CO60282 957 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 GAS8O95995 478 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT14P02533 472 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 C9P02748 559 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35G4P0C7Q5 338 aa18.28■□□□□ 0.52
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