RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CRHR2Q13324 411 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 RUNX2Q13950 521 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 VWC2Q2TAL6 325 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PRR27Q6MZM9 219 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CEP85Q6P2H3 762 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 LRIG3Q6UXM1 1119 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM110Q86TL2 294 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINA11Q86U17 422 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SFTPA2Q8IWL1 248 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SCCPDHQ8NBX0 429 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 HUS1BQ8NHY5 278 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 OCC1Q8TAD7 63 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 IGSF8Q969P0 613 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SLAMF9Q96A28 289 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM186Q96B77 213 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ALG14Q96F25 216 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM237Q96Q45 408 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 MMS19Q96T76 1030 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CIPCQ9C0C6 399 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 HIPK3Q9H422 1215 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 DNAJC18Q9H819 358 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ARL8BQ9NVJ2 186 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ASIC5Q9NY37 505 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 COQ3Q9NZJ6 369 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 MAD2L2Q9UI95 211 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 FBXL5Q9UKA1 691 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TSPAN16Q9UKR8 245 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ACSL5Q9ULC5 683 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CCPG1Q9ULG6 757 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TNS3Q68CZ2 1445 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 GAGE12JA6NER3 117 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PPP6CO00743 305 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ATP2A1O14983 1001 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PALMO75781 387 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 JTBO76095 146 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 MOCS3O95396 460 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 GUCA1CO95843 209 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ALPPP05187 535 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PDHA1P08559 390 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CD63P08962 238 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ALPPL2P10696 532 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PEPDP12955 493 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 VCLP18206 1134 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TACR3P29371 465 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PTGS2P35354 604 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 IDUAP35475 653 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ME1P48163 572 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 NAE1Q13564 534 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 COL28A1Q2UY09 1125 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 AARDQ4LEZ3 155 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TIGD2Q4W5G0 525 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PCID2Q5JVF3 399 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TAF3Q5VWG9 929 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 GGNBP1Q5YKI7 109 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SIGIRRQ6IA17 410 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 DHRS13Q6UX07 377 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 RHOUQ7L0Q8 258 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 DPPA4Q7L190 304 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CYB5R4Q7L1T6 521 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SPRED1Q7Z699 444 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 KLHL7Q8IXQ5 586 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 TTC9BQ8N6N2 239 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CHST13Q8NET6 341 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 LPCAT1Q8NF37 534 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 OR8K5Q8NH50 307 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 RASSF8Q8NHQ8 419 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 MAGEC3Q8TD91 643 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CFAP53Q96M91 514 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 FAM210AQ96ND0 272 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF570Q96NI8 536 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 RUNDC3BQ96NL0 473 aa2.23□□□□□ -2.05
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PDE4D-218ENST00000509368 RUFY1Q96T51 708 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 ACOX2Q99424 681 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 AIFM2Q9BRQ8 373 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 EQTNQ9NQ60 294 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 PNPLA3Q9NST1 481 aa2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PDE4D-218ENST00000509368 SPG21Q9NZD8 308 aa2.23□□□□□ -2.05
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