RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507316.1

TUSC3-205, Transcript of tumor suppressor candidate 3, human

TSL 3

Gene TUSC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUSC3-205	ENST00000507316	ABAT	P80404	500 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	GLO1	Q04760	184 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	ZNF91	Q05481	1191 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	PUDP	Q08623	228 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	ABR	Q12979	859 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	PAK1	Q13153	545 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	SQSTM1	Q13501	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	PNOC	Q13519	176 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	FGL2	Q14314	439 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	KCNJ12	Q14500	433 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	ZNF273	Q14593	569 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	SLC9A5	Q14940	896 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	ZMYND11	Q15326	602 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	ZNF385B	Q569K4	471 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	DDI2	Q5TDH0	399 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	LIN54	Q6MZP7	749 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	CGB2	Q6NT52	195 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	WDR59	Q6PJI9	974 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	VSTM1	Q6UX27	236 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	USP49	Q70CQ1	688 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	NAGS	Q8N159	534 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	CADM2	Q8N3J6	435 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	STX19	Q8N4C7	294 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	DTX3	Q8N9I9	347 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	LEMD2	Q8NC56	503 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	MCU	Q8NE86	351 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	GTF2H4	Q92759	462 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	TOP1MT	Q969P6	601 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	FAM227B	Q96M60	508 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	RILP	Q96NA2	401 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	TBCB	Q99426	244 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	PLIN2	Q99541	437 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	CHP1	Q99653	195 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	IDI2	Q9BXS1	227 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	TRIM2	Q9C040	744 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	SETD4	Q9NVD3	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	DUX4	Q9UBX2	424 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	LIPT1	Q9Y234	373 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	PLLP	Q9Y342	182 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TUSC3-205	ENST00000507316	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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