RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MOCOS	Q96EN8	888 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf34	Q96MH7	638 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ING2	Q9H160	280 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	GAN	Q9H2C0	597 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ZWILCH	Q9H900	591 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RMI1	Q9H9A7	625 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNA1D	Q01668	2161 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	GRID2	O43424	1007 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC6	O75061	913 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN1	O95832	211 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	C9	P02748	559 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF5	P12034	268 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL4A	P40617	200 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	KLK7	P49862	253 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBB3	Q13509	450 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT8	Q16880	541 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	INSC	Q1MX18	579 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SYVN1	Q86TM6	617 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PGBD5	Q8N414	524 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF214	Q8ND24	703 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	COX14	Q96I36	57 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MGME1	Q9BQP7	344 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR87	Q9BY21	358 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	NT5M	Q9NPB1	228 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	KLC4	Q9NSK0	619 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RARRES3	Q9UL19	164 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ESPL1	Q14674	2120 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PDHA1	P08559	390 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CA4	P22748	312 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN4	P29074	926 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	STC1	P52823	247 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH6	P55285	790 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	OGDH	Q02218	1023 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	MR1	Q95460	341 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM14	Q96QK8	99 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	RUFY1	Q96T51	708 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	AGPAT1	Q99943	283 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	UCK1	Q9HA47	277 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	PARVA	Q9NVD7	372 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	OGFR	Q9NZT2	677 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CWC15	Q9P013	229 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CENPE	Q02224	2701 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ITPR2	Q14571	2701 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0J9YYE9	177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511		A6NL46	340 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN7	O95471	211 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBC1	P01850	177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	MIP	P30301	263 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINB6	P35237	376 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ADM	P35318	185 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPZB	P47756	277 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	JAM2	P57087	298 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ACY1	Q03154	408 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	XP32	Q5T750	250 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SKAP2-209	ENST00000497511	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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