RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496569.1

HDLBP-246, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-246ENST00000496569 SLC39A1Q9NY26 324 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-246ENST00000496569 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-246ENST00000496569 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-246ENST00000496569 PDP2Q9P2J9 529 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-246ENST00000496569 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-246ENST00000496569 PRSS21Q9Y6M0 314 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-246ENST00000496569 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.96□□□□□ -0.49
HDLBP-246ENST00000496569 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 MGAT4DA6NG13 374 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 AGAP14A8MT82 685 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 K7ENP7 123 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CEP104O60308 925 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 FGGP02679 453 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 HALP42357 657 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 LMAN1P49257 510 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CYP4F2P78329 520 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 BCL7AQ4VC05 210 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 IRGCQ6NXR0 463 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 WASH2PQ6VEQ5 465 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 NAPRTQ6XQN6 538 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CERS6Q6ZMG9 384 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CCDC81Q6ZN84 652 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 SNX20Q7Z614 316 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 DTX1Q86Y01 620 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 DNAAF3Q8N9W5 541 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 DCUN1D1Q96GG9 259 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 C9orf72Q96LT7 481 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PPM1MQ96MI6 270 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 COPS8Q99627 209 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 SEMA4CQ9C0C4 833 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 WASH6PQ9NQA3 447 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 ACSL6Q9UKU0 697 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 FER1L5A0AVI2 2057 aa11.95□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 RASSF9O75901 435 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 C1QL1O75973 258 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 C9P02748 559 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF28P17035 718 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 ACRV1P26436 265 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PDHA2P29803 388 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 FOXN2P32314 431 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 HADHAP40939 763 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CAPZBP47756 277 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PREPP48147 710 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PRLHRP49683 370 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 VPS41P49754 854 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CRADDP78560 199 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 SEMA5AQ13591 1074 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 LY6DQ14210 128 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PLCL1Q15111 1095 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 MANEAQ5SRI9 462 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 METRNLQ641Q3 311 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CFAP206Q8IYR0 622 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CCDC89Q8N998 374 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 OR13J1Q8NGT2 312 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 OR2L2Q8NH16 312 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 STYXQ8WUJ0 223 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 ULK4Q96C45 1275 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 MS4A14Q96JA4 679 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CCDC88CQ9P219 2028 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 MROH6A6NGR9 719 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 B4E171 279 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 E7EVH7 732 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 H7C0S8 307 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PSMD3O43242 534 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 RAD1O60671 282 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 GOT2P00505 430 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 APRTP07741 180 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 SLC35G4P0C7Q5 338 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 ITGB6P18564 788 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 FDFT1P37268 417 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 TSPAN7P41732 249 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 UCNP55089 124 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PDE1BQ01064 536 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 MC2RQ01718 297 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms