RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	KCNAB3	O43448	404 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	SSX4	O60224	188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CCR3	P51677	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	PPP5C	P53041	499 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CDH13	P55290	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	COASY	Q13057	564 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	ALCAM	Q13740	583 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CBWD6	Q4V339	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	HHATL	Q9HCP6	504 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	TULP2	O00295	520 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	DVL1	O14640	695 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	BMP10	O95393	424 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	MYBL1	P10243	752 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	GM2A	P17900	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	DNASE1	P24855	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CCKAR	P32238	428 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	AHR	P35869	848 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	FUT6	P51993	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	ASIC2	Q16515	512 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	ACOT8	O14734	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	GCNT3	O95395	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CPT2	P23786	658 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	GABRA5	P31644	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	MLLT10	P55197	1068 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CDK3	Q00526	305 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	TROAP	Q12815	778 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	NR1D2	Q14995	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	SPATA20	Q8TB22	786 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	OLFM1	Q99784	485 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	OLAH	Q9NV23	265 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SKAP2-208	ENST00000495802	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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