RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 WDR41Q9HAD4 459 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GALPQ9UBC7 116 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 A8MX80 341 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SUPT3HB4E1H0 165 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 UBDO15205 165 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 YKT6O15498 198 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FKBP6O75344 327 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PRLP01236 227 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ASLP04424 464 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CTPS1P17812 591 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PEX2P28328 305 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ECT2LQ008S8 904 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TXNDC8Q6A555 127 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ISLR2Q6UXK2 745 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 DDIASQ8IXT1 998 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TRPC4APQ8TEL6 797 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TADA1Q96BN2 335 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 C3orf30Q96M34 536 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FKBPLQ9UIM3 349 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 VPS28Q9UK41 221 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 YIPF1Q9Y548 306 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GTL3 188 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 IQCF5A8MTL0 148 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 K7ERQ8 282 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CDC7O00311 574 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 BNIP3LO60238 219 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TBL1XO60907 577 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 NIPSNAP2O75323 286 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CLDN11O75508 207 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TRIM16O95361 564 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CRTAMO95727 393 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CD1DP15813 335 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 IMPDH1P20839 514 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 STC1P52823 247 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FOXA1P55317 472 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 DNAJB13P59910 316 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MS4A2Q01362 244 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SEMG2Q02383 582 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CDC16Q13042 620 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 LSAMPQ13449 338 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CEACAM7Q14002 265 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FLOT2Q14254 428 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CYTH1Q15438 398 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 UNC50Q53HI1 259 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ADGRF1Q5T601 910 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SCIMPQ6UWF3 145 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 HTR3DQ70Z44 454 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CCDC126Q96EE4 140 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TRIB3Q96RU7 358 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GPR21Q99679 349 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MGME1Q9BQP7 344 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 INIPQ9NRY2 104 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 BTRCQ9Y297 605 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 DOCK6Q96HP0 2047 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GVM2 712 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TXNDC9O14530 226 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 KDELR3O43731 214 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PRAMEF12O95522 483 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 EPOP01588 193 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GSTT2P0CG29 244 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GSTT2BP0CG30 244 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FDXRP22570 491 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PRDX6P30041 224 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GKP32189 559 aa6.93□□□□□ -1.3
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