RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PGBD5	Q8N414	524 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	RSC1A1	Q92681	617 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PDE7B	Q9NP56	450 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	VPS18	Q9P253	973 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	RARRES3	Q9UL19	164 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SEC16A	O15027	2179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MFSD11	O43934	449 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	KIF5C	O60282	957 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MAFK	O60675	156 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	VIP	P01282	170 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PTPN7	P35236	360 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ITGA1	P56199	1179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MAX	P61244	160 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	DYNLT1	P63172	113 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PTS	Q03393	145 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	GBE1	Q04446	702 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CDK18	Q07002	472 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	GALNT2	Q10471	571 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	TUBB3	Q13509	450 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	LAMB3	Q13751	1172 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	IRGC	Q6NXR0	463 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	AADACL2	Q6P093	401 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	NPNT	Q6UXI9	565 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	HPS6	Q86YV9	775 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF599	Q96NL3	588 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	RANBP9	Q96S59	729 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	HEMGN	Q9BXL5	484 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	UCK1	Q9HA47	277 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	DTL	Q9NZJ0	730 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MX2	P20592	715 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CAPZB	P47756	277 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	NR2C2	P49116	596 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PDE1B	Q01064	536 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	RAPSN	Q13702	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	KCNAB1	Q14722	419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	BBS12	Q6ZW61	710 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	NLRP8	Q86W28	1048 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SLC35F6	Q8N357	371 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	MR1	Q95460	341 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	TSGA13	Q96PP4	275 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	RMI1	Q9H9A7	625 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	KLC4	Q9NSK0	619 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	GPR83	Q9NYM4	423 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	TACC2	O95359	2948 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	GRID2	O43424	1007 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM63A	O94886	807 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	TJP3	O95049	919 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	PDHA1	P08559	390 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	FOLR1	P15328	257 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CCNC	P24863	283 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SLC19A1	P41440	591 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	STC1	P52823	247 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	CCNY	Q8ND76	341 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	P3H4	Q92791	437 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM3-208	ENST00000489344	HDAC11	Q96DB2	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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