RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 NADK2Q4G0N4 442 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 COQ5Q5HYK3 327 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 KRT80Q6KB66 452 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TERB1Q8NA31 727 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CHST14Q8NCH0 376 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 OR4K2Q8NGD2 314 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 OR6K2Q8NGY2 324 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 OR4L1Q8NH43 312 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 FAM81AQ8TBF8 368 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 SORCS1Q8WY21 1168 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 FGF14Q92915 247 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 NXPE3Q969Y0 559 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 NXNL1Q96CM4 212 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 L3HYPDHQ96EM0 354 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 MPP4Q96JB8 637 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TCF12Q99081 682 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 POPDC3Q9HBV1 291 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 DEC1Q9P2X7 70 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CROTQ9UKG9 612 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 GMEB1Q9Y692 573 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC160A6NGH7 325 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 OR51F1A6NGY5 319 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 AQP12BA6NM10 295 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 A8MT66 165 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 AGAP14A8MT82 685 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TAS2R39P59534 338 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 PRAMEP78395 509 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 MYBPC1Q00872 1141 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 RAD51Q06609 339 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 KCTD21Q4G0X4 260 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 GRAMD4Q6IC98 578 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CNSTQ6PJW8 725 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 Q6ZVU0 165 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CUZD1Q86UP6 607 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 AQP12AQ8IXF9 295 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ANKFN1Q8N957 763 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 OR6P1Q8NGX9 317 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 KLHL32Q96NJ5 620 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 BIRC8Q96P09 236 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 OMDQ99983 421 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 HEPHQ9BQS7 1158 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM245Q9H330 911 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CLDND1Q9NY35 253 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 DKK3Q9UBP4 350 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 MYRFQ9Y2G1 1151 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFAF1Q9Y375 327 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF711Q9Y462 761 aa9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 PIEZO1Q92508 2521 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 VILLO15195 856 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 NRP2O60462 931 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 H6PDO95479 791 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CTSLP07711 333 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 ALPIP09923 528 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TIMP2P16035 220 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CTPS1P17812 591 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 IMPDH1P20839 514 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 CD9P21926 228 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 TTKP33981 857 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 GMPRP36959 345 aa9.47□□□□□ -0.89
POLR1A-208ENST00000486964 SUOXP51687 545 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms