RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 SRMSQ9H3Y6 488 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 AURKCQ9UQB9 309 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ACTL7AQ9Y615 435 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC154A6NI56 674 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 C5orf67F2Z3F1 127 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FKBP9O95302 570 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TGDSO95455 350 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GNAZP19086 355 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 STEAP4Q687X5 459 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CYP4X1Q8N118 509 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LZICQ8WZA0 190 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FOXJ1Q92949 421 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FAM162AQ96A26 154 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SPDL1Q96EA4 605 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 C7orf26Q96N11 449 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 BBS4Q96RK4 519 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 COQ6Q9Y2Z9 468 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CEP290O15078 2479 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FFAR2O15552 330 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CLCNKAP51800 687 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CYP51A1Q16850 503 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FANCEQ9HB96 536 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SGK2Q9HBY8 427 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC167Q9P0B6 97 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HAO1Q9UJM8 370 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FAM170BA6NMN3 283 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NPHS1O60500 1241 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 KERAO60938 352 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TNNI3P19429 210 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CCND1P24385 295 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GTF2H2Q13888 395 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 INAVAQ3KP66 663 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PARP9Q8IXQ6 854 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GPR135Q8IZ08 494 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GPR174Q9BXC1 333 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 BTRCQ9Y297 605 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 IGLON5A6NGN9 336 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GFRA2O00451 464 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SCAMP1O15126 338 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 COX7A2P14406 83 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PCSK2P16519 638 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ACRV1P26436 265 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SOX9P48436 509 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC18A1P54219 525 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SQLEQ14534 574 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TEX12Q9BXU0 123 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 DERL2Q9GZP9 239 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 MTG2Q9H4K7 406 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SELENONQ9NZV5 590 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC189A1A4V9 331 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 H0Y858 1186 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SEMA4FO95754 770 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 GSTM1P09488 218 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 CDH3P22223 829 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PGFP49763 221 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 SATB1Q01826 763 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 GSTM4Q03013 218 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 EML3Q32P44 896 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 MANEALQ5VSG8 457 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRD-211ENST00000486161 PARM1Q6UWI2 310 aa8.15□□□□□ -1.11
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