RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GPR180	Q86V85	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ARSG	Q96EG1	525 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NEK1	Q96PY6	1258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	DDO	Q99489	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	USP32	Q8NFA0	1604 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	BECN2	A8MW95	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541		B4DGG1	531 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541		J3KR12	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PSMA7	O14818	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SLC16A5	O15375	505 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ZBTB43	O43298	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TSPAN1	O60635	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ZWINT	O95229	277 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	LCAT	P04180	440 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	FGF2	P09038	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PFKFB1	P16118	471 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CDC25A	P30304	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MXI1	P50539	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CLCNKA	P51800	687 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TRAF1	Q13077	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	IL11RA	Q14626	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TNIP1	Q15025	636 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SETD6	Q8TBK2	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MTBP	Q96DY7	904 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RGS14	O43566	566 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SRC	P12931	536 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GLUL	P15104	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	UGT1A1	P22309	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	NR4A2	P43354	598 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF75D	P51815	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TAS2R38	P59533	333 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PPP2R2B	Q00005	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	BFSP1	Q12934	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	RALGDS	Q12967	914 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GPS2	Q13227	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	SCARB2	Q14108	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	EFNB3	Q15768	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RNF216-208	ENST00000479541	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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