RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 CCNG2Q16589 344 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 DCAF12Q5T6F0 453 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 TRIM58Q8NG06 486 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 COPS8Q99627 209 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 CRLS1Q9UJA2 301 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 RIMKLBQ9ULI2 386 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 TPH1P17752 444 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 MC4RP32245 332 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 GFERP55789 205 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 NKD1Q969G9 470 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 TLR10Q9BXR5 811 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF148Q9UQR1 794 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 CFAP99D6REC4 459 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 AGRPO00253 132 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 AMD1P17707 334 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ACRV1P26436 265 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 MAPK9P45984 424 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 TMPRSS15P98073 1019 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 CDH17Q12864 832 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 GPR150Q8NGU9 434 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 HM13Q8TCT9 377 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 KLHL6Q8WZ60 621 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 SLC39A7Q92504 469 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 RSC1A1Q92681 617 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 RANBP9Q96S59 729 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ZMYND15Q9H091 742 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 A8MU76 341 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 GSTM1P09488 218 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 TYRP1P17643 537 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 GSTM4Q03013 218 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ACVR1Q04771 509 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 CACNG1Q06432 222 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 POU6F1Q14863 301 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 SNAP47Q5SQN1 464 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ANKS6Q68DC2 871 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 CEACAM20Q6UY09 585 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 DET1Q7L5Y6 550 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 FAM129CQ86XR2 697 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 PEX13Q92968 403 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 CCM2Q9BSQ5 444 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 CASS4Q9NQ75 786 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 PAK5Q9P286 719 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 PILRAQ9UKJ1 303 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 CCL22O00626 93 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 LAMB3Q13751 1172 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 MANEAQ5SRI9 462 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 KLHL35Q6PF15 583 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 C4orf22Q6V702 233 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 OR52K1Q8NGK4 314 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 ZDHHC12Q96GR4 267 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 SGSM3Q96HU1 749 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 PSMD13Q9UNM6 376 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf3-215ENST00000478473 AP2A2O94973 939 aa22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 IFNB1P01574 187 aa22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 RPA4Q13156 261 aa22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 ITIH4Q14624 930 aa22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 GLIS1Q8NBF1 620 aa22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 WWP1Q9H0M0 922 aa22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 FASNP49327 2511 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 HEATR9A2RTY3 570 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 FOXN2P32314 431 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 CD151P48509 253 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 ATP1A2P50993 1020 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 PACS1Q6VY07 963 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 CFAP206Q8IYR0 622 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 TGM7Q96PF1 710 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 CD180Q99467 661 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 OR52A5Q9H2C5 316 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf3-215ENST00000478473 COG4Q9H9E3 785 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms