RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477371.5

MRPL38-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L38, human

TSL 2

Gene MRPL38, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL38-208	ENST00000477371	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		10	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371		A0A1W2PQM1	296 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371		E7ESA3	106 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SMAP	O00193	183 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	AP2A2	O94973	939 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	TRIM16	O95361	564 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	OR56A5	P0C7T3	313 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	VCL	P18206	1134 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	PAM	P19021	973 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	PDHA2	P29803	388 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ALDH4A1	P30038	563 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	FMO4	P31512	558 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SLC1A2	P43004	574 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ABCG1	P45844	678 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	TTPA	P49638	278 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	MPP1	Q00013	466 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	HHEX	Q03014	270 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ILK	Q13418	452 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	BIRC2	Q13490	618 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	TUBB2A	Q13885	445 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	LONRF1	Q17RB8	773 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	AMZ1	Q400G9	498 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SPRED1	Q7Z699	444 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	KCNMB4	Q86W47	210 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CCNJL	Q8IV13	435 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	BBOF1	Q8ND07	529 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	MNS1	Q8NEH6	495 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	GPR150	Q8NGU9	434 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	HM13	Q8TCT9	377 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ELMO1	Q92556	727 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	LPGAT1	Q92604	370 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ART4	Q93070	314 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	FAM136A	Q96C01	138 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	TTC1	Q99614	292 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ABCG4	Q9H172	646 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	P2RY12	Q9H244	342 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		9.99	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CACNA1A	O00555	2505 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	AGRP	O00253	132 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	KCNJ13	O60928	360 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	NIPSNAP2	O75323	286 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	S1PR4	O95977	384 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	MT-CO3	P00414	261 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	GP1BA	P07359	652 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CCR7	P32248	378 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	MAPK9	P45984	424 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	FASLG	P48023	281 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	E2F1	Q01094	437 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	RPE65	Q16518	533 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ARMC3	Q5W041	872 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	STEAP4	Q687X5	459 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CNST	Q6PJW8	725 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	USP53	Q70EK8	1073 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CCDC25	Q86WR0	208 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	VRK3	Q8IV63	474 aa		9.98	□□□□□ -0.81
MRPL38-208	ENST00000477371	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		9.98	□□□□□ -0.81

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