RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ANKRD54Q6NXT1 300 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CES3Q6UWW8 571 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 TTC9BQ8N6N2 239 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 POC5Q8NA72 575 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 AGR3Q8TD06 166 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 FOXJ1Q92949 421 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 IGSF8Q969P0 613 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ITPKCQ96DU7 683 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 TM6SF2Q9BZW4 377 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CD274Q9NZQ7 290 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 H3BQ06 376 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 TRIM13O60858 407 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 DGKAP23743 735 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 SLC26A3P40879 764 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 MAPK11Q15759 364 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ALFQ53S48 1182 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 DEFB123Q8N688 67 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 UBE2E3Q969T4 207 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 MFSD3Q96ES6 412 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ING4Q9UNL4 249 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 GRXCR1A8MXD5 290 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 COCHO43405 550 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 HOXB2P14652 356 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CXCR2P25025 360 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 PSMD8P48556 350 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 SLC1A6P48664 564 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 BST1Q10588 318 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 POM121L1PQ3SYA9 428 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 MPP7Q5T2T1 576 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 TAS1R1Q7RTX1 841 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 STYXQ8WUJ0 223 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ARHGEF3Q9NR81 526 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ING3Q9NXR8 418 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 AHSPQ9NZD4 102 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ZNF221Q9UK13 617 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 FBXO5Q9UKT4 447 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 NEMP2A6NFY4 417 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 TPST1O60507 370 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 TNFRSF21O75509 655 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CNTN5O94779 1100 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CCNDBP1O95273 360 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 PROCP04070 461 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 DUSP6Q16828 381 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 GALNTL6Q49A17 601 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ZNF470Q6ECI4 717 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 HDDC3Q8N4P3 179 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 FAM45AQ8TCE6 357 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 PROX1Q92786 737 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 REPS1Q96D71 796 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 UGT2B28Q9BY64 529 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 ABCB8Q9NUT2 735 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 WWOXQ9NZC7 414 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.57□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.56□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 CCDC189A1A4V9 331 aa7.56□□□□□ -1.2
USP54-210ENST00000466048 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms