RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	NEK1	Q96PY6	1258 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PP11	408 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PRAC2	D3DTV9	90 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PRAMEF11	O60813	436 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TBX10	O75333	385 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PSMD10	O75832	226 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	MYBL1	P10243	752 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	AMD1	P17707	334 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CCR3	P51677	355 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CD81	P60033	236 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	COG7	P83436	770 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PSMD6	Q15008	389 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC96	Q2M329	555 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CEP57	Q86XR8	500 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	KMT5C	Q86Y97	462 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	FKRP	Q9H9S5	495 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TRBC2	A0A5B9	178 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	OR2M5	A3KFT3	312 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454		A8MXE2	369 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	GGPS1	O95749	300 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	MYOD1	P15172	320 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	AMPH	P49418	695 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PPP5C	P53041	499 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SLC20A2	Q08357	652 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	IL11RA	Q14626	422 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	MELK	Q14680	651 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ACCSL	Q4AC99	568 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SATL1	Q86VE3	508 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TC2N	Q8N9U0	490 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	TTC14	Q96N46	770 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	SLC22A12	Q96S37	553 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	PKP4	Q99569	1192 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	IL17B	Q9UHF5	180 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454	YIPF1	Q9Y548	306 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PS18	150 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	OR5K3	A6NET4	321 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	C15orf62	A8K5M9	175 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	PLK4	O00444	970 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	ZNHIT1	O43257	154 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	SSX4	O60224	188 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	CREG1	O75629	220 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	CDH1	P12830	882 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	PFKFB1	P16118	471 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	TERF1	P54274	439 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	CDH13	P55290	713 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	DLX5	P56178	289 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	ISL1	P61371	349 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	PLIN5	Q00G26	463 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	GTF2H2	Q13888	395 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF234	Q14588	700 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	NR1D2	Q14995	579 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	LETM2	Q2VYF4	491 aa		3.96	□□□□□ -1.78
CLK1-208	ENST00000464454	RAB6C	Q53S08	254 aa		3.96	□□□□□ -1.78

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