RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 GNPDA1P46926 289 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PMS2P54278 862 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MPP1Q00013 466 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 IL9RQ01113 521 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PPARDQ03181 441 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MGAT5Q09328 741 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 C1orf61Q13536 156 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GTF2H3Q13889 308 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SLMAPQ14BN4 828 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 HLA-BQ31612 363 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF789Q5FWF6 425 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM220Q6QAJ8 160 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CERS6Q6ZMG9 384 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 RELL1Q8IUW5 271 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 RBFAQ8N0V3 343 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR150Q8NGU9 434 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FBF1Q8TES7 1133 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SGF29Q96ES7 293 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PDXPQ96GD0 296 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC25Q96NG3 672 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 COPS8Q99627 209 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GSX2Q9BZM3 304 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GAREM1Q9H706 876 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 IL21RQ9HBE5 538 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SMYD2Q9NRG4 433 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 MOCS1Q9NZB8 636 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXO5Q9UKT4 447 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SUFUQ9UMX1 484 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TNFRSF10CO14798 259 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GRID2O43424 1007 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 VEGFDO43915 354 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NUAK1O60285 661 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SDC3O75056 442 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NDUFS3O75489 264 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 HAUS5O94927 633 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ACSL3O95573 720 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CSF2P04141 144 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 IVLP07476 585 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SYPP08247 313 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 RALBP11234 206 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 OGNP20774 298 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 FMO4P31512 558 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ADH7P40394 386 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCG1P45844 678 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TTPAP49638 278 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 HK3P52790 923 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CTSCP53634 463 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 BNIP3Q12983 259 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ITIH4Q14624 930 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 SHBQ15464 509 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CSRP2Q16527 193 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PYCR3Q53H96 274 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 COX20Q5RI15 118 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PARGQ86W56 976 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 CALML6Q8TD86 181 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 HEXDCQ8WVB3 486 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TTC1Q99614 292 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD28-208ENST00000463533 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms