RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 SYPP08247 313 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CBSLP0DN79 551 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 COL6A2P12110 1019 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ACP5P13686 325 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CTSEP14091 401 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 JUNDP17535 347 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 AOAHP28039 575 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CCR7P32248 378 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CBSP35520 551 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC26A3P40879 764 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEA12P43365 314 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CLCNKAP51800 687 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 IL2P60568 153 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.931e-9■■■■■ 27.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 DMPKQ09013 629 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 TCF15Q12870 199 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 RPA4Q13156 261 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 LPAL2Q16609 132 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SYTL3Q4VX76 610 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 HSP90B2PQ58FF3 399 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 AGBL2Q5U5Z8 902 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 LAYNQ6UX15 382 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 C11orf96Q7Z7L8 435 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 TRABD2AQ86V40 505 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 LCA5Q86VQ0 697 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP97Q8IW35 865 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP4X1Q8N118 509 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PRSS33Q8NF86 280 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CD200R1Q8TD46 325 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 MZB1Q8WU39 189 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 NAT14Q8WUY8 206 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM159Q96B96 161 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM136AQ96C01 138 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PDXPQ96GD0 296 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SH3GL2Q99962 352 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 KLC4Q9NSK0 619 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SPASTQ9UBP0 616 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ACSL5Q9ULC5 683 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 MED16Q9Y2X0 877 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ACOT9Q9Y305 439 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A096LPK6 155 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 YKT6O15498 198 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 GPC4O75487 556 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 RFPL1O75677 317 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SLCO2B1O94956 709 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 C2P06681 752 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 RETP07949 1114 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 IDSP22304 550 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 MPLP40238 635 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CTSKP43235 329 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 MAPK9P45984 424 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 RXRGP48443 463 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 CCT5P48643 541 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
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SH3BP4-208ENST00000462602 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 ELOCQ15369 112 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM83EQ2M2I3 478 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF19Q2TAC6 998 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM61Q5EBN2 209 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 AGAP9Q5VTM2 703 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BP4-208ENST00000462602 METRNLQ641Q3 311 aa9.22□□□□□ -0.93
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SH3BP4-208ENST00000462602 NEK10Q6ZWH5 1172 aa9.22□□□□□ -0.93
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