RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 LILRA5A6NI73 299 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 EFCAB8A8MWE9 144 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 H3BMM5 538 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 KPNA5O15131 536 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 KDM1AO60341 852 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 AVILO75366 819 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 NMBRP28336 390 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 CCKBRP32239 447 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 CALCOCO2Q13137 446 aa20.17■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 SYTL3Q4VX76 610 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 ZNF534Q76KX8 674 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 PLXDC1Q8IUK5 500 aa20.17■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 SNF8Q96H20 258 aa20.17■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 URI1O94763 535 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 USP1O94782 785 aa20.16■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 CD151P48509 253 aa20.16■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 NCSTNQ92542 709 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 ELMO1Q92556 727 aa20.15■□□□□ 0.82
IMP4-209ENST00000462357 C12orf66Q96MD2 445 aa20.15■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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IMP4-209ENST00000462357 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-209ENST00000462357 FBXO39Q8N4B4 442 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-209ENST00000462357 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
IMP4-209ENST00000462357 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
IMP4-209ENST00000462357 ZDHHC12Q96GR4 267 aa20.14■□□□□ 0.81
IMP4-209ENST00000462357 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.14■□□□□ 0.81
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