RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 NDUFS3O75489 264 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 VCLP18206 1134 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CTSCP53634 463 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 VSNL1P62760 191 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 SEMA3AQ14563 771 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 C11orf91Q3C1V1 193 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 DET1Q7L5Y6 550 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC25Q86WR0 208 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF547Q8IVP9 402 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PALM2Q8IXS6 379 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 EID2Q8N6I1 236 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF217Q8TC41 542 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 BOCQ9BWV1 1114 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 FRYQ5TBA9 3013 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 IGF2RP11717 2491 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2AG2A6NM03 316 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA8KD6RF30 607 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA8TH3BQL2 631 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 POP7O75817 140 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GSTA2P09210 222 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GSTM1P09488 218 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GIMD1P0DJR0 217 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ACP5P13686 325 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGEA4P43358 317 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GSTM4Q03013 218 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 INSCQ1MX18 579 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TYSND1Q2T9J0 566 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 DEFB133Q30KQ1 61 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 AMZ2Q86W34 360 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNMB4Q86W47 210 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC6Q86X45 466 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 NRROSQ86YC3 692 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CILP2Q8IUL8 1156 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM46DQ8NEK8 389 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CCL4L1Q8NHW4 92 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GSDMBQ8TAX9 411 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 GLMNQ92990 594 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 VPS37BQ9H9H4 285 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TOR4AQ9NXH8 423 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CHD6Q8TD26 2715 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM38O00635 465 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 SGTAO43765 313 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 OR56A5P0C7T3 313 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 AK4P27144 223 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ACTR1BP42025 376 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CARSP49589 748 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PRLHRP49683 370 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ACTR1AP61163 376 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TCEA2Q15560 299 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF470Q6ECI4 717 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 C11orf96Q7Z7L8 435 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM181AQ8N9Y4 354 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CERS2Q96G23 380 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 FMO2Q99518 471 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CCM2Q9BSQ5 444 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 KLC4Q9NSK0 619 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TAAR2Q9P1P5 351 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 LHX6Q9UPM6 363 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 BTBD3Q9Y2F9 522 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 MGAT4DA6NG13 374 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFSF14O43557 240 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 SIGLEC6O43699 453 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 OR1I1O60431 355 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 ERVK-10P10266 1014 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 DMPKQ09013 629 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC30A9Q6PML9 568 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CYS1Q717R9 158 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 RELL1Q8IUW5 271 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CLDN19Q8N6F1 224 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2L2Q8NH16 312 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 TSSK1BQ9BXA7 367 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PLAC1Q9HBJ0 212 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGEF1-205ENST00000450873 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms