RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 TCP11X1B4DZS4 312 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 GPR39O43194 453 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 POP7O75817 140 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM63AO94886 807 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 NDST3O95803 873 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 KRT1P04264 644 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 FAM228BP0C875 321 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 HLA-DPA1P20036 260 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 CDH3P22223 829 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 KDELR1P24390 212 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 COL8A1P27658 744 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 SPAM1P38567 509 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 CTSCP53634 463 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 GSDMDP57764 484 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 PRKAA1Q13131 559 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 KRT33BQ14525 404 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 PDK1Q15118 436 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 NOMO1Q15155 1222 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 NR6A1Q15406 480 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM220Q6QAJ8 160 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 NPNTQ6UXI9 565 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 RFX6Q8HWS3 928 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 RHOT1Q8IXI2 618 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 D2HGDHQ8N465 521 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A41Q8N5S1 370 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 PLD5Q8N7P1 536 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 FDCSPQ8NFU4 85 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 BRSK1Q8TDC3 778 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 CPT1BQ92523 772 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 RAPGEF5Q92565 580 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 RNF157Q96PX1 679 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 CD180Q99467 661 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 NUDT9Q9BW91 350 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 WWP1Q9H0M0 922 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 KCND1Q9NSA2 647 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 GPR83Q9NYM4 423 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa10.06□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 SVILO95425 2214 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 NUP210LQ5VU65 1888 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 GSAPA4D1B5 854 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM150CB9EJG8 249 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 BUD23O43709 281 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 UGT1A9O60656 530 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 LCA5LO95447 670 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 DDAH2O95865 285 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 SLC35G4P0C7Q5 338 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 TNNT1P13805 278 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 UGT1A6P19224 532 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 MSH3P20585 1137 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 CYP2A7P20853 494 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 UGT1A1P22309 533 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 UGT1A4P22310 534 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 ATP1A4Q13733 1029 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 GSE1Q14687 1217 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 MESDQ14696 234 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 LDLRAP1Q5SW96 308 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 SLC6A19Q695T7 634 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 LCN10Q6JVE6 187 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 OR8K5Q8NH50 307 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 SGSM3Q96HU1 749 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 PPM1MQ96MI6 270 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 UGT1A7Q9HAW7 530 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 UGT1A10Q9HAW8 530 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 UGT1A8Q9HAW9 530 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 GLOD4Q9HC38 313 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 SEMA5BQ9P283 1151 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 UVRAGQ9P2Y5 699 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa10.05□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 A0A1W2PQJ5 194 aa10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 C9J4A7 227 aa10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 KRT86O43790 486 aa10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 KCNJ13O60928 360 aa10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 MBD3O95983 291 aa10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 H2AFZP0C0S5 128 aa10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 LPOP22079 712 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 VARSP26640 1264 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 OTX2P32243 289 aa10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 DCTP40126 519 aa10.04□□□□□ -0.8
DDX39B-211ENST00000449757 VAV2P52735 878 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms