RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449489.5

RBM39-218, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 5

Gene RBM39, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-218ENST00000449489 ZNF30P17039 623 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 RORAP35398 523 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 SCNN1BP51168 640 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 PAK1Q13153 545 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 LLGL1Q15334 1064 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 DCAF10Q5QP82 559 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 TTI2Q6NXR4 508 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 C20orf204Q6ZNR8 217 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 USP45Q70EL2 814 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 SLFN11Q7Z7L1 901 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 FAM71AQ8IYT1 594 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 CCDC185Q8N715 623 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 PAF1Q8N7H5 531 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 SLC38A9Q8NBW4 561 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 CLEC1AQ8NC01 280 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 GRHL3Q8TE85 626 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 NACC2Q96BF6 587 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 RNF31Q96EP0 1072 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 BTBD6Q96KE9 485 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 CD180Q99467 661 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 CARD9Q9H257 536 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 MCCC2Q9HCC0 563 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 KCND1Q9NSA2 647 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ZANQ9Y493 2812 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 F5H423 210 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 GOLGA8SH3BPF8 625 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 GRID2O43424 1007 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 VEGFDO43915 354 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 NUAK1O60285 661 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ASMTLO95671 621 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 CPP00450 1065 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ALBP02768 609 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 CD63P08962 238 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 MSL3P1P0C860 447 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ACP5P13686 325 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 CA5AP35218 305 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 KRTAP10-9P60411 292 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 HSD11B2P80365 405 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 IL10RBQ08334 325 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ATP1A4Q13733 1029 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 SSPNQ14714 243 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ASIC2Q16515 512 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 CDO1Q16878 200 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 RAB6CQ53S08 254 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 DENND2CQ68D51 928 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 GJB7Q6PEY0 223 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 KLHL35Q6PF15 583 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 FAM92BQ6ZTR7 304 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 EMC1Q8N766 993 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ACBD4Q8NC06 268 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 CPT1BQ92523 772 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 RSC1A1Q92681 617 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 SCAMP4Q969E2 229 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 ZNF599Q96NL3 588 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 NUDCD1Q96RS6 583 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-218ENST00000449489 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms