RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 HACD1B0YJ81 288 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 H7C0C1 242 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TIAF1O95411 115 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PRAMEF1O95521 474 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 FOLR1P15328 257 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 MSH3P20585 1137 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 FECHP22830 423 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP5OP48047 213 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ARL4DP49703 201 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 HADHBP55084 474 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 XRCC4Q13426 336 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TUBB3Q13509 450 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 OLIG2Q13516 323 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ITGA9Q13797 1035 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 IGFBP7Q16270 282 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 LONRF2Q1L5Z9 754 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC181Q5TID7 509 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 KLHL35Q6PF15 583 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM135Q86UB9 458 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP1R3BQ86XI6 285 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF398Q8TD17 642 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 UBXN4Q92575 508 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC41A2Q96JW4 573 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 APOL2Q9BQE5 337 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 GORASP1Q9BQQ3 440 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB33BQ9H082 229 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 WWP1Q9H0M0 922 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 GBA3Q9H227 469 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SEMA5BQ9P283 1151 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ANAPC2Q9UJX6 822 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TRHDEQ9UKU6 1024 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 RARRES3Q9UL19 164 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PADI1Q9ULC6 663 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 KCTD3Q9Y597 815 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNMB2Q9Y691 235 aa10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 MACROD2A1Z1Q3 448 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PIPSLA2A3N6 862 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 CDC14CA4D256 554 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 APOC2P02655 101 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 NTRK1P04629 796 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 FURINP09958 794 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 EBLN1P0CF75 366 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 NR1D1P20393 614 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 LPOP22079 712 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 RBL1P28749 1068 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 CASRP41180 1078 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 GEMP55040 296 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 DNASE1L3Q13609 305 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SEPT6Q14141 434 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 METRNLQ641Q3 311 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 C11orf63Q6NUN7 778 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 DAAM2Q86T65 1068 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TC2NQ8N9U0 490 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 OR4K2Q8NGD2 314 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 CT55Q8WUE5 264 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 MAP3K3Q99759 626 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM118BQ9BPY3 351 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TWSG1Q9GZX9 223 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ASB8Q9H765 288 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 PDE7BQ9NP56 450 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 LHX9Q9NQ69 397 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SMOXQ9NWM0 555 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 HRASLS2Q9NWW9 162 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 FKBPLQ9UIM3 349 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 POLHQ9Y253 713 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 NOTCH2Q04721 2471 aa10.07□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 OR5K3A6NET4 321 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 MGAT4DA6NG13 374 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 TLCD2A6NGC4 264 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 C2orf81A6NN90 581 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 K7EM74 188 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 CREG1O75629 220 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 ANXA9O76027 345 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP4-206ENST00000446904 SRP72O76094 671 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms