RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442343.1

RPSAP40-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 40, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP40, Length 891 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP40-201ENST00000442343 GNA12Q03113 381 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 RPS6KA1Q15418 735 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 TAF5Q15542 800 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 TESK1Q15569 626 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 MYLK3Q32MK0 819 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ARTNQ5T4W7 220 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ESX1Q8N693 406 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 OR7D4Q8NG98 312 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 OR56A4Q8NGH8 313 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ACTRT1Q8TDG2 376 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 NT5C3BQ969T7 300 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 RTP4Q96DX8 246 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 PDXPQ96GD0 296 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 RUFY1Q96T51 708 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 MIPEPQ99797 713 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 SIK2Q9H0K1 926 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 WDCPQ9H6R7 721 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 SIX2Q9NPC8 291 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 POLHQ9Y253 713 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ANKRD36A6QL64 1941 aa6.36□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 FBN3Q75N90 2809 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 B4DGG1 531 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 K7EM74 188 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 KRIT1O00522 736 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 SRGAP2O75044 1071 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 PALMO75781 387 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 FGF1P05230 155 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 UGT2B4P06133 528 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 CCNB1P14635 433 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 COL8A1P27658 744 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ALDH4A1P30038 563 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 KIR3DL1P43629 444 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 SNX16P57768 344 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 RAD51Q06609 339 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 NME3Q13232 169 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 PDCLQ13371 301 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 GTF2H3Q13889 308 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 GRM3Q14832 879 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 AMZ1Q400G9 498 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ANKS6Q68DC2 871 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 DENND1BQ6P3S1 775 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 CDH24Q86UP0 819 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 HPS6Q86YV9 775 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 LMO3Q8TAP4 145 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ZNF606Q8WXB4 792 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 SEC14L1Q92503 715 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 RUNDC3BQ96NL0 473 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 NPY6RQ99463 290 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 SH3GL2Q99962 352 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.35□□□□□ -1.39
RPSAP40-201ENST00000442343 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms