RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PKMYT1Q99640 499 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CMKLR1Q99788 373 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 KCNJ14Q9UNX9 436 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 C2CD2Q9Y426 696 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 USP27XA6NNY8 438 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PRSS44E7EML9 344 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 MID1O15344 667 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 NKX2-8O15522 239 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ADRB2P07550 413 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 GIMD1P0DJR0 217 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ATP1A3P13637 1013 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 LIFP15018 202 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 GOT1P17174 413 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF542PQ5EBM4 170 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 HAUS3Q68CZ6 603 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CHST9Q7L1S5 443 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 HDAC11Q96DB2 347 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PCED1BQ96HM7 432 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 LRRC27Q9C0I9 530 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 MED13LQ71F56 2210 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ZFHX3Q15911 3703 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ATP8B3O60423 1300 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 LATO43561 262 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 CD99P14209 185 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CD1EP15812 388 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 MUTP22033 750 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ACOT2P49753 483 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 ADPRHP54922 357 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 HDAC4P56524 1084 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 LMX1AQ8TE12 382 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 P2RY11Q96G91 374 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 CDH19Q9H159 772 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 SNX25Q9H3E2 840 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 THAP9Q9H5L6 903 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRK-211ENST00000429595 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 INTUQ9ULD6 942 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PADI4Q9UM07 663 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 U3KQA8 63 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 NUMA1Q14980 2115 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 GABRDO14764 452 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 TPP1O14773 563 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-211ENST00000429595 SLC31A1O15431 190 aa6.25□□□□□ -1.41
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