RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 C9orf72Q96LT7 481 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 RUFY1Q96T51 708 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ZPBPQ9BS86 351 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ISCUQ9H1K1 167 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 VPS18Q9P253 973 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.45□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 MATN3O15232 486 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 GRID2O43424 1007 aa6.44□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 NUAK1O60285 661 aa6.44□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 FOXM1Q08050 763 aa6.44□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 ESX1Q8N693 406 aa6.44□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 GPR26Q8NDV2 337 aa6.44□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.44□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.44□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 A0A0G2JNG1 304 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.43□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 CCDC172P0C7W6 258 aa6.43□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 GNLYP22749 145 aa6.43□□□□□ -1.38
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HOXD8-202ENST00000429017 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 SASS6Q6UVJ0 657 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 PQLC3Q8N755 202 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 CNTD1Q8N815 330 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 NSMCE1Q8WV22 266 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXD8-202ENST00000429017 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.43□□□□□ -1.38
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