RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM30AQ9NV96 361 aa3.01□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF224Q9NZL3 707 aa3.01□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 WDR35Q9P2L0 1181 aa3.01□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 WDR97A6NE52 1622 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 SYNJ2O15056 1496 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 GAPVD1Q14C86 1478 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 DVL1O14640 695 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 SLC16A5O15375 505 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 PRAMEF11O60813 436 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 GGPS1O95749 300 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 BCL10O95999 233 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 GJA1P17302 382 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 CPT2P23786 658 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 DDR1Q08345 913 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ASIC2Q16515 512 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 CST9LP1Q5W188 147 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 NADSYN1Q6IA69 706 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM211Q6ICI0 200 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 TRNP1Q6NT89 227 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 CHST3Q7LGC8 479 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 C1orf87Q8N0U7 546 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 AFAP1Q8N556 730 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 SLC5A8Q8N695 610 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 CFAP61Q8NHU2 1237 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 TANKQ92844 425 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 PIGTQ969N2 578 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 RMDN1Q96DB5 314 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 C3orf30Q96M34 536 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 PCYT2Q99447 389 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 MEIS3Q99687 375 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 IL25Q9H293 177 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 OLAHQ9NV23 265 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 HAO2Q9NYQ3 351 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 SELENONQ9NZV5 590 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa3□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 KIF27Q86VH2 1401 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 FYNP06241 537 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 LINGO3P0C6S8 592 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 TUBA1BP68363 451 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 DLG1Q12959 904 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 MYBPHQ13203 477 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 UBE2V1Q13404 147 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 KEAP1Q14145 624 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 NR1D2Q14995 579 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ARMC3Q5W041 872 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 FBXL22Q6P050 247 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 TEX38Q6PEX7 206 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 PRSS57Q6UWY2 283 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 CREB3L2Q70SY1 520 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 CAMKMTQ7Z624 323 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ANKRD23Q86SG2 305 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 VSIG1Q86XK7 387 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 LMO3Q8TAP4 145 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 TBC1D16Q8TBP0 767 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 WDR20Q8TBZ3 569 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM255BQ8WV15 326 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 SLC44A1Q8WWI5 657 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 MS4A10Q96PG2 267 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 CD93Q9NPY3 652 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 SH3GLB2Q9NR46 395 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 FGD5Q6ZNL6 1462 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 OR2M5A3KFT3 312 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 OR5K3A6NET4 321 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ZBTB43O43298 467 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 BUD23O43709 281 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 SSX4O60224 188 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 KDM4BO94953 1096 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ZWINTO95229 277 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 PMS2P2O95744 297 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 HSPA4LO95757 839 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 USP8P40818 1118 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 TMPOP42166 694 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 CDH13P55290 713 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 CDK3Q00526 305 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC82-202ENST00000423339 ROR1Q01973 937 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms