RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MESDQ14696 234 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOMO1Q15155 1222 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC18A3Q16572 532 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IZUMO3Q5VZ72 239 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM151BQ6UXP7 276 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OOSP2Q86WS3 158 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFX6Q8HWS3 928 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM126BQ8IUX1 230 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSC4DQ8WTU2 575 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MR1Q95460 341 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEKT5Q96M29 485 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ING2Q9H160 280 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MED13Q9UHV7 2174 aa12.86□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2AG2A6NM03 316 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT1P04264 644 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM253P0C7T8 217 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LPOP22079 712 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CA5AP35218 305 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTGIRP43119 386 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYNLT1P63172 113 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPM4P67936 248 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XRCC4Q13426 336 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGA9Q13797 1035 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR19Q15760 415 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRNA6Q15825 494 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP2R5EQ16537 467 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPRC6AQ5T6X5 926 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM220Q6QAJ8 160 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDELC1Q6UW63 502 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARFQ8N187 725 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8K5Q8NH50 307 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST8Q9H2A9 424 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LATS2Q9NRM7 1088 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCND1Q9NSA2 647 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HRASLS2Q9NWW9 162 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL17CQ9P0M4 197 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM153AQ9UHL3 310 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOTCH2Q04721 2471 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT1A9O60656 530 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEMA7AO75326 666 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEACAM4O75871 244 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF224P0DH78 156 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT1A6P19224 532 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NFKB1P19838 968 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT1A1P22309 533 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT1A4P22310 534 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD68P34810 354 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WNT3AP56704 352 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSDMDP57764 484 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIRPB2Q5JXA9 342 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMTC4Q5T4D3 741 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METRNLQ641Q3 311 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC38A9Q8NBW4 561 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf66Q96MD2 445 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRFN5Q96NI6 719 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT1A7Q9HAW7 530 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT1A10Q9HAW8 530 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UGT1A8Q9HAW9 530 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMOXQ9NWM0 555 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOHLH2Q9NX45 425 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HACD3Q9P035 362 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC24A2Q9UI40 661 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX7Q9UNH6 387 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTRCQ9Y297 605 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa12.85□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM63AO94886 807 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPOP01588 193 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB40ALP0C0E4 278 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKT1P31749 480 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRNA4P43681 627 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WASHC5Q12768 1159 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ESPL1Q14674 2120 aa12.84□□□□□ -0.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1027.7 ms