RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC38A5Q8WUX1 472 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITLN1Q8WWA0 313 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 EXOC4Q96A65 974 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 GCC1Q96CN9 775 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM227BQ96M60 508 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 QRFPRQ96P65 431 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 HAUS8Q9BT25 410 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 BACH2Q9BYV9 841 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYSLTR2Q9NS75 346 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC38A7Q9NVC3 462 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 OPN4Q9UHM6 478 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 RSPH14Q9UHP6 348 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHA6Q9UN73 950 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNRQ92752 1358 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC88CQ9P219 2028 aa-1.13□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CACNA1GO43497 2377 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV40A0A0B4J280 105 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GUA9 196 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC189A1A4V9 331 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 BTN3A1O00481 513 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 VIL1P09327 827 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 TFPIP10646 304 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 FCGR2AP12318 317 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 TPH1P17752 444 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTPS1P17812 591 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATF3P18847 181 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCLP19338 710 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFAIP3P21580 790 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDHA2P29803 388 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 HLA-FP30511 346 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 OAZ1P54368 228 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 GUCY2DQ02846 1103 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 BLMHQ13867 455 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLS1Q14651 629 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 LETM2Q2VYF4 491 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCA11PQ4W5N1 156 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9orf66Q5T8R8 295 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLXDC2Q6UX71 529 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 PACS1Q6VY07 963 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 BBS12Q6ZW61 710 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 MON1AQ86VX9 555 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 C2CD5Q86YS7 1000 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 RDM1Q8NG50 284 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4N2Q8NGD1 307 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4Q3Q8NH05 313 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4C3Q8NH37 302 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR6S1Q8NH40 331 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC22A8Q8TCC7 542 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA1524Q8TCG1 905 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAPK15Q8TD08 544 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 GANCQ8TET4 914 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERGIC1Q969X5 290 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAF2Q96CS3 445 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF183Q96D59 192 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAR2Q96K12 515 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCYT2Q99447 389 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 DPH1Q9BZG8 443 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 NANOGQ9H9S0 305 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNK9Q9NPC2 374 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 HPS4Q9NQG7 708 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXO28Q9NVF7 368 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 HPSEQ9Y251 543 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa-1.14□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 PALLDQ8WX93 1383 aa-1.14□□□□□ -2.59
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A1B0GWB2 263 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 FRG2CA6NGY1 282 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP6V0E1O15342 81 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 GPX5O75715 221 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 RCBTB2O95199 551 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHEP01854 428 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 FTLP02792 175 aaPredicted RBP-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGRP09769 529 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CISD3P0C7P0 127 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCP11498 1178 aaKnown RBP-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL1R1P14778 569 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 VCAM1P19320 739 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLRA1P23415 457 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP3A7P24462 503 aa-1.15□□□□□ -2.59
RNU6-172P-201ENST00000411000 LMO2P25791 158 aa-1.15□□□□□ -2.59
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