RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 PFDN6O15212 129 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 PARP15Q460N3 678 aa14.84□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 PELI3Q8N2H9 469 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ANKFN1Q8N957 763 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 GJB5O95377 273 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 NDST3O95803 873 aa14.84□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 PIK3CGP48736 1102 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 VBP1P61758 197 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 SELENBP1Q13228 472 aa14.84□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 APOL5Q9BWW9 433 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.84□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 CD300AQ9UGN4 299 aa14.84□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 CLDN25C9JDP6 229 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ARPC2O15144 300 aa14.84□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 SLC11A2P49281 568 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 ACADVLP49748 655 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 SEMG2Q02383 582 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 INPP5AQ14642 412 aa14.84□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 BEND5Q7L4P6 421 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 DBF4BQ8NFT6 615 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 C8orf48Q96LL4 319 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 MROH6A6NGR9 719 aa14.83□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 ECI2O75521 394 aa14.83□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.83□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.83□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.83□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.83□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.83□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.83□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 PALMDQ9NP74 551 aa14.83□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 CMTM6Q9NX76 183 aa14.83□□□□□ -0.03
ATG4B-206ENST00000405546 MTRRQ9UBK8 725 aa14.83□□□□□ -0.03
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ATG4B-206ENST00000405546 JRKO75564 520 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 DLGAP3O95886 979 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 CAPNS1P04632 268 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 STC1P52823 247 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
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ATG4B-206ENST00000405546 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 LINGO1Q96FE5 620 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.83□□□□□ -0.04
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ATG4B-206ENST00000405546 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
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ATG4B-206ENST00000405546 OR1D2P34982 312 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 ACLYP53396 1101 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 SMUG1Q53HV7 270 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 RTP2Q5QGT7 225 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 AFMIDQ63HM1 303 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 SCML4Q8N228 414 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-206ENST00000405546 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.83□□□□□ -0.04
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