RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 ANXA9O76027 345 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 FCGR1AP12314 374 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 SEPHS1P49903 392 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 POU6F1Q14863 301 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM135Q86UB9 458 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 STK32CQ86UX6 486 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 CEP97Q8IW35 865 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 MAGED4Q96JG8 741 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 MYRFLQ96LU7 910 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 DACH2Q96NX9 599 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 PSD2Q9BQI7 771 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 RHOJQ9H4E5 214 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 SARDHQ9UL12 918 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa11.06□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAJC13O75165 2243 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 E9PAM4 449 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 SERPIND1P05546 499 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 ITGB6P18564 788 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 ATP6V0D1P61421 351 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 YBX1P67809 324 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 GPM6BQ13491 265 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 XAF1Q6GPH4 301 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TBPL2Q6SJ96 375 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC39A11Q8N1S5 342 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 MARCH7Q9H992 704 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 ANAPC2Q9UJX6 822 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 ADAM12O43184 909 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 ASNA1O43681 348 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 SUPT7LO94864 414 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 CXCL10P02778 98 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 GFAPP14136 432 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 HTR1BP28222 390 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 HADHAP40939 763 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB10P61026 200 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 SMUG1Q53HV7 270 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 GPR158Q5T848 1215 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM236Q5W0B7 351 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 UGT3A1Q6NUS8 523 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TMC5Q6UXY8 1006 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 CYP2U1Q7Z449 544 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 SPRED1Q7Z699 444 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 HEATR4Q86WZ0 1026 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 HEXDCQ8WVB3 486 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 ZUFSPQ96AP4 578 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 SDCCAG3Q96C92 435 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 LTB4R2Q9NPC1 389 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TLR9Q9NR96 1032 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 MARCH5Q9NX47 278 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 IFT52Q9Y366 437 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1W2PRU2 124 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIM64BA6NI03 449 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 C16orf96A6NNT2 1141 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 NOTOA8MTQ0 251 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 SNPHO15079 494 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 NPHS1O60500 1241 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 AHSGP02765 367 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 PAMP19021 973 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TGM1P22735 817 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 CES1P23141 567 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 COPZ1P61923 177 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 ECT2LQ008S8 904 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 RAD51Q06609 339 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TXNDC8Q6A555 127 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 S100ZQ8WXG8 99 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TM6SF2Q9BZW4 377 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 INSL5Q9Y5Q6 135 aa11.05□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 KIAA0355O15063 1070 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 GUCY1B2O75343 617 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 KCNA5P22460 613 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 CYP4F8P98187 520 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 CAMK2BQ13554 666 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TUBA3CQ13748 450 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 RABL3Q5HYI8 236 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 SPARTQ8N0X7 666 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 NTAN1Q96AB6 310 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 CLIP3Q96DZ5 547 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 FAR2Q96K12 515 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 RTP3Q9BQQ7 232 aa11.04□□□□□ -0.64
RPRD1B-201ENST00000373433 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms