RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSHBP01222 138 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS56P0CW18 603 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERVK-10P10266 1014 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CKMT2P17540 419 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHRNB4P30926 498 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXC8P31273 242 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 DRG2P55039 364 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP2R2BQ00005 443 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMP22Q01453 160 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFAP5Q13361 173 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNC3Q14003 757 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCE1EQ5T753 118 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADGRF2Q8IZF7 708 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC39CQ8N584 583 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF248Q8NDW4 579 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEMA4DQ92854 862 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC34Q96HJ3 373 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 DACH2Q96NX9 599 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLR3GLQ9BT43 218 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTTG2Q9NZH5 202 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNMA2Q9UL42 364 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2CD2Q9Y426 696 aa2.87□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PR77 199 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUXAA6NLW8 204 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 LDLRP01130 860 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERPINB2P05120 415 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 H1F0P07305 194 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAPN3P20807 821 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 NMBRP28336 390 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALDH4A1P30038 563 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 HADHAP40939 763 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GARSP41250 739 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERVK11-1P61568 191 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADALQ6DHV7 355 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLC3Q6P597 504 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CERS3Q8IU89 383 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 L3MBTL4Q8NA19 623 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2T12Q8NG77 320 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SKA1Q96BD8 255 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 EVI5LQ96CN4 794 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRR1Q96L50 414 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP295NLQ96MC4 621 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIGD1Q96MW7 591 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ECHDC1Q9NTX5 307 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAS2R14Q9NYV8 317 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJB4Q9UDY4 337 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 A6NL46 340 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 HHLA1C9JL84 531 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTGES3LE9PB15 166 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MITFO75030 526 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBED4O75132 1171 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTP4A3O75365 173 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF224P0DH78 156 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMP9P14780 707 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CBLP22681 906 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPHA2P29317 976 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMB10P40306 273 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMC4P43686 418 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC15A1P46059 708 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 THOP1P52888 689 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFAP4P55083 255 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS18P62269 152 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNB1P62873 340 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLA2G7Q13093 441 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT33BQ14525 404 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 GCNT6Q5T4J0 391 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXL22Q6P050 247 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ISCA2Q86U28 154 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCEMP1Q8IX19 187 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRYBG2Q8N1P7 616 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM58Q8NG06 486 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D16Q8TBP0 767 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC47A1Q96FL8 570 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC22A12Q96S37 553 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHNO1Q9BSD3 238 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 HRH4Q9H3N8 390 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLA2Q9H6Q3 261 aa2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms