RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357943.9

CCNE1-202, Transcript of cyclin E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNE1, Length 1,641 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1-202ENST00000357943 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 TMEM131Q92545 1883 aa14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 HMX2A2RU54 273 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 MGAT4DA6NG13 374 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 E5RI56 91 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 H3BMM5 538 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 AQP9O43315 295 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 ITGA2BP08514 1039 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SAT1P21673 171 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 ACTR1BP42025 376 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 CLCN7P51798 805 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 ACTR1AP61163 376 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 ELOCQ15369 112 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 CFAP206Q8IYR0 622 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SLC25A45Q8N413 288 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 DCAKDQ8WVC6 231 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 ELMO2Q96JJ3 720 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 PANX3Q96QZ0 392 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SLC30A3Q99726 388 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 OLFM1Q99784 485 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 VWA7Q9Y334 891 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 IKBKGQ9Y6K9 419 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 DMXL1Q9Y485 3027 aa14.6□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 PRR19A6NJB7 356 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 DFNA5O60443 496 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 CCT8P50990 548 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 DMPKQ09013 629 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 BMPR2Q13873 1038 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 MROH9Q5TGP6 573 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 PIM3Q86V86 326 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 HM13Q8TCT9 377 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SAP25Q8TEE9 199 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 GPR21Q99679 349 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 GPR22Q99680 433 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 CCDC77Q9BR77 488 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 EDEM2Q9BV94 578 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 TSSK1BQ9BXA7 367 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 COG4Q9H9E3 785 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 FETUBQ9UGM5 382 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 PLAAQ9Y263 795 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 CFAP54Q96N23 3096 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 F8W8V4 182 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 YY2O15391 372 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 EML2O95834 649 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 VCLP18206 1134 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 AOAHP28039 575 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SLCO1A2P46721 670 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 PREPP48147 710 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 TAS2R39P59534 338 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 ZNF460Q14592 562 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 NFS1Q9Y697 457 aa14.59□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.58□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.58□□□□□ -0.07
CCNE1-202ENST00000357943 SLC5A10A0PJK1 596 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNE1-202ENST00000357943 SMIM23A6NLE4 172 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNE1-202ENST00000357943 LMO7DNF2Z398 122 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNE1-202ENST00000357943 YKT6O15498 198 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNE1-202ENST00000357943 GDF9O60383 454 aa14.58□□□□□ -0.08
CCNE1-202ENST00000357943 SNX2O60749 519 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms