RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 POF1BQ8WVV4 589 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 FEM1AQ9BSK4 669 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GMIPQ9P107 970 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CLDN4O14493 209 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MEIS2O14770 477 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 APODP05090 189 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PAX3P23760 479 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 LINGO4Q6UY18 593 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 OR10H4Q8NGA5 316 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 RMI1Q9H9A7 625 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 FAM105AQ9NUU6 356 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 UPB1Q9UBR1 384 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 OR4Q2P0C623 313 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ECHS1P30084 290 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CLCQ05315 142 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SLC1A5Q15758 541 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PARP15Q460N3 678 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 RFKQ969G6 155 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MGME1Q9BQP7 344 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TTPALQ9BTX7 342 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 OR51V1Q9H2C8 321 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TOR3AQ9H497 397 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MALT1Q9UDY8 824 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 COL6A2P12110 1019 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 NCK1P16333 377 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 NRG3P56975 720 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SLC20A2Q08357 652 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GTF2H2Q13888 395 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MSANTD2Q6P1R3 559 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 NRSN1Q8IZ57 195 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 LIX1Q8N485 282 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MUC13Q9H3R2 512 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.89■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 OR1F1O43749 312 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PPM1AP35813 382 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ADAM8P78325 824 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 LINGO2Q7L985 606 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PGAM4Q8N0Y7 254 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ERVK-5Q9HDB9 667 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TSPAN4O14817 238 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 OR1I1O60431 355 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CMPK1P30085 196 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ADRA1BP35368 520 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SP140Q13342 867 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 QSOX2Q6ZRP7 698 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 STRADAQ7RTN6 431 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 NODALQ96S42 347 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 HBEGFQ99075 208 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 MPZL2O60487 215 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CYB5AP00167 134 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ALDH4A1P30038 563 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 VLDLRP98155 873 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SP3Q02447 781 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CRY2Q49AN0 593 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 OGFOD2Q6N063 350 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ZYG11AQ6WRX3 759 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CHST9Q7L1S5 443 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 GALNT13Q8IUC8 556 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 OR14C36Q8NHC7 312 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 COQ8BQ96D53 544 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 DEC1Q9P2X7 70 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 CCL22O00626 93 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 DSC2Q02487 901 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ZNF234Q14588 700 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 UGCGQ16739 394 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 RFWD3Q6PCD5 774 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 SLC26A9Q7LBE3 791 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 DMRTB1Q96MA1 342 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 ELOVL2Q9NXB9 296 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15.88■□□□□ 0.13
RXRA-201ENST00000356384 EPHX1P07099 455 aa15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms