RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARNT2Q9HBZ2 717 aa22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 AGAP14A8MT82 685 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 STK17BO94768 372 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLA2G2AP14555 144 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF28P17035 718 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBR1Q16650 682 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 METRNLQ641Q3 311 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 IRGCQ6NXR0 463 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 CEACAM20Q6UY09 585 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 MED8Q96G25 268 aa22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNJ13O60928 360 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 RASSF9O75901 435 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 CRTAMO95727 393 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM87AP0C7U9 286 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 FOXM1Q08050 763 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 PARP6Q2NL67 630 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 NXPE1Q8N323 547 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 TTC13Q8NBP0 860 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 CRLS1Q9UJA2 301 aa22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCDC78A2IDD5 438 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 MGAT4DA6NG13 374 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 DLGAP3O95886 979 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 MC4RP32245 332 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 BCL7AQ4VC05 210 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 CACHD1Q5VU97 1274 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 NLGN4XQ8N0W4 816 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR2L2Q8NH16 312 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR6C1Q96RD1 312 aa22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITGB2P05107 769 aa22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 POLBP06746 335 aa22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 SEPT6Q14141 434 aa22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 POU6F1Q14863 301 aa22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 CERS6Q6ZMG9 384 aa22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF605Q86T29 641 aa22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 C12orf66Q96MD2 445 aa22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 IL17BQ9UHF5 180 aa22.22■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 ITGALP20701 1170 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 KCNAB1Q14722 419 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLCL1Q15111 1095 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 SNX20Q7Z614 316 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 KLHL6Q8WZ60 621 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 NRTNQ99748 197 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 EPHA6Q9UF33 1036 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.21■■□□□ 1.15
TNFRSF25-201ENST00000348333 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 NKX2-8O15522 239 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 TIAF1O95411 115 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 AP2A1O95782 977 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 PRLHRP49683 370 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 PDE1BQ01064 536 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 CFAP206Q8IYR0 622 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZDHHC12Q96GR4 267 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 COPS8Q99627 209 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAP3K3Q99759 626 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZPBPQ9BS86 351 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 ULBP3Q9BZM4 244 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAB33BQ9H082 229 aa22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 TENM4Q6N022 2769 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR51F1A6NGY5 319 aa22.19■■□□□ 1.14
TNFRSF25-201ENST00000348333 LIASO43766 372 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms